Differenza chiave: elettroforesi su gel e pagina SDS
L'elettroforesi su gel è una tecnica che separa le macromolecole in un campo elettrico. È un metodo comune in biologia molecolare per separare DNA, RNA e proteine dalle miscele in base alle loro dimensioni molecolari. SDS Page è un tipo di elettroforesi su gel che viene utilizzata per separare le proteine da una miscela proteica in base alle loro dimensioni. L'elettroforesi su gel è un termine usato per riferirsi alla normale tecnica applicata per la separazione di DNA, RNA e proteine mentre la pagina SDS è un tipo di elettroforesi su gel. Questa è la differenza chiave tra l'elettroforesi su gel e la pagina SDS.
Cos'è l'elettroforesi su gel?
L'elettroforesi su gel è una tecnica comune utilizzata nei laboratori per separare le molecole cariche come DNA, RNA, proteine, ecc. dalle loro miscele. Un gel viene utilizzato nell'elettroforesi su gel. Agisce come un setaccio molecolare. Esistono due tipi di gel utilizzati nell'elettroforesi su gel, vale a dire agarosio e poliacrilammide. La selezione di un gel e la preparazione del gel sono fattori importanti da considerare nelle elettroforesi su gel poiché la dimensione dei pori del gel deve essere manipolata con cura per una buona separazione delle molecole attraverso l'elettroforesi su gel. L'elettroforesi su gel ha un campo elettrico collegato a due estremità del gel. Un'estremità del gel mostra una carica positiva mentre l' altra estremità è caricata negativamente.
DNA e RNA sono molecole caricate negativamente. Una volta caricati nel gel dall'estremità negativa del gel e applicati al campo elettrico, migrano attraverso i pori del gel verso l'estremità caricata positivamente del gel. La velocità della migrazione dipende dalla carica e dalle dimensioni della molecola. Le molecole più piccole migrano facilmente attraverso i pori del gel rispetto alle molecole più grandi. Quindi, le molecole più piccole percorrono una lunga distanza attraverso il gel e le molecole più grandi percorrono una breve distanza. Per osservare il viaggio delle molecole sul gel, vengono utilizzati tipi speciali di coloranti. Il campo elettrico viene applicato per un certo periodo di tempo e interrotto per prevenire la perdita di molecole e per mantenere le molecole nelle posizioni percorse. Diverse bande possono essere osservate nel gel. Queste bande rappresentano le molecole di diverse dimensioni. Quindi, l'elettroforesi su gel è utile per differenziare le molecole in base alle loro dimensioni.
L'elettroforesi su gel è incorporata in varie tecniche come tecnica preparativa in biologia molecolare come PCR, RFLP, clonazione, sequenziamento del DNA, Southern blotting, mappatura del genoma, ecc.
Figura 01: Elettroforesi su gel di agarosio
Cos'è la pagina SDS?
L'elettroforesi su gel di poliacrilammide con dodecil solfato di sodio (Pagina SDS) è un tipo di elettroforesi su gel utilizzata per separare le proteine. Quando l'elettroforesi su gel viene utilizzata per separare le proteine, sono necessari trattamenti speciali poiché le proteine non sono caricate negativamente come il DNA e l'RNA e non migrano verso l'estremità positiva o negativa. Quindi, le proteine vengono denaturate e rivestite con una carica negativa prima dell'elettroforesi su gel. Viene eseguito utilizzando un detergente chiamato sodio dodecil solfato (SDS). L'elettroforesi su gel che utilizza SDS e un gel di poliacrilammide per il supporto è nota come SDS Page. Questa tecnica è comunemente usata in biochimica, genetica, medicina legale e biologia molecolare.
Durante la pagina SDS, le proteine vengono mescolate con l'SDS. SDS dispiega le proteine in una forma lineare e le ricopre con una carica negativa proporzionale alla loro massa molecolare. A causa della carica negativa, le molecole proteiche migrano verso l'estremità della carica positiva del gel e si separano in base alle loro masse molecolari. In SDS Page, il poliacrilammide viene utilizzato come supporto solido per il gel. L'effettiva separazione delle proteine dipende principalmente dalle proprietà del gel. Pertanto, la preparazione del gel di poliacrilammide deve essere eseguita con attenzione e devono essere utilizzate concentrazioni corrette di poliacrilammide. I gel di poliacrilammide mostrano un'elevata risoluzione rispetto ai gel di agarosio. Quindi, SDS Page è considerata una tecnica ad alta risoluzione per la separazione delle proteine.
SDS Page è un tipo di elettroforesi su gel denaturante. Ha una limitazione importante nell'analisi delle proteine. Poiché l'SDS denatura le proteine prima della separazione, non consente il rilevamento di attività enzimatica, interazioni di legame proteico, cofattori proteici, ecc.
Figura 02: Pagina SDS
Qual è la differenza tra l'elettroforesi su gel e la pagina SDS?
Gel elettroforesi vs pagina SDS |
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| L'elettroforesi su gel è un metodo eseguito per separare le macromolecole utilizzando un campo elettrico. | SDS Page è una tecnica di elettroforesi su gel ad alta risoluzione utilizzata per separare le proteine in base alla loro massa. |
| Gel Run | |
| Può essere eseguito in modo orizzontale o verticale. | La pagina SDS viene sempre eseguita in verticale. |
| Base per la separazione | |
| La separazione avviene in base all'addebito e alle dimensioni. | La separazione delle proteine avviene in base alla massa e alla carica. |
| Risoluzione | |
| L'elettroforesi su gel di agarosio ha una bassa risoluzione e l'elettroforesi su gel di poliacrilammide ha una risoluzione maggiore | La pagina SDS ha una risoluzione migliore. |
| Denaturazione | |
| L'elettroforesi su gel include tecniche sia denaturanti che non denaturanti. | La pagina SDS denatura le proteine prima della separazione. |
Riepilogo – Elettroforesi su gel vs pagina SDS
L'elettroforesi su gel è una tecnica comune utilizzata per la separazione e l'analisi di DNA, RNA e proteine in base alla loro dimensione e carica. Esistono due tipi principali di elettroforesi su gel: l'elettroforesi su gel di agarosio e l'elettroforesi su gel di poliacrilammide. I gel di agarosio sono usati principalmente per la separazione degli acidi nucleici; quando è richiesta una risoluzione maggiore, vengono utilizzati gel di poliacrilammide. SDS Page è un tipo di elettroforesi su gel comunemente usato per separare miscele complesse di proteine. È considerata una tecnica di separazione delle proteine ad alta risoluzione. Questa è la differenza tra l'elettroforesi su gel e la pagina SDS.
