La differenza chiave tra l'elettroforesi su gel 1D e 2D sono le proprietà utilizzate per la separazione delle proteine sull'elettroforesi su gel. L'elettroforesi su gel 1D separa solo le proteine in base al peso molecolare, mentre l'elettroforesi su gel 2D separa le proteine in base al suo punto isoelettrico e al peso molecolare.
La separazione delle proteine mediante elettroforesi su gel è una tecnica importante per caratterizzare le proteine. Le proteine hanno proprietà variabili; pertanto, la separazione è più complessa rispetto alla separazione del DNA mediante elettroforesi su gel di agarosio.
Cos'è l'elettroforesi su gel 1D?
1D L'elettroforesi su gel, nota anche come elettroforesi su gel monodimensionale, è un metodo di separazione delle proteine basato sul peso molecolare. La separazione delle proteine avviene principalmente mediante elettroforesi su gel di poliacrilammide. Basandosi sul concetto di elettroforesi su gel, le molecole si separano in base alla loro proprietà di peso molecolare e carica.
Pertanto, per dare una carica uniforme alle proteine, il trattamento con sodio dodecil solfato (SDS) viene eseguito prima dell'elettroforesi su gel. SDS denatura le proteine e fornisce una carica negativa uniforme sulla proteina; quando avviene l'applicazione del campo elettrico, le proteine migrano verso il terminale positivo in base al loro peso molecolare. Pertanto, nella separazione, viene considerata una sola proprietà. Questo è il motivo per cui questo metodo è definito elettroforesi su gel 1D.
Figura 01: Elettroforesi su gel 1D
Durante l'elettroforesi su gel 1D, le proteine vengono separate in base al loro peso molecolare. A questo proposito, le molecole di peso inferiore migrano più velocemente nel gel rispetto alle proteine ad alto peso molecolare. Pertanto, le proteine ad alto peso rimangono vicine ai pozzetti.
Cos'è l'elettroforesi su gel 2D?
L'elettroforesi su gel 2D o l'elettroforesi su gel bidimensionale separa le proteine in base a due proprietà. Le due proprietà sono il punto isoelettrico della proteina e il peso molecolare. Questo metodo di separazione delle proteine aumenta la risoluzione della separazione delle proteine. Il punto isoelettrico della proteina dipende dal pH a cui la proteina è neutra.
Figura 02: Elettroforesi su gel 2D
Così, nell'elettroforesi su gel 2D, la proteina può funzionare su un gradiente di pH fisso nella prima dimensione. Nella seconda dimensione, le proteine vengono separate mediante elettroforesi su gel di poliacrilammide verticale o orizzontale. Pertanto, le proteine si separano in base al loro peso molecolare nella seconda dimensione.
Inoltre, questo metodo di elettroforesi su gel aumenta la risoluzione della separazione delle proteine. Pertanto, le proteine separate sono più pure. Tuttavia, il costo della tecnica è molto più alto dell'elettroforesi su gel a una dimensione.
Quali sono le somiglianze tra l'elettroforesi su gel 1D e 2D?
- Entrambe le tecniche separano le proteine.
- Quindi, sono importanti nella caratterizzazione delle proteine.
Qual è la differenza tra l'elettroforesi su gel 1D e 2D?
La differenza fondamentale tra l'elettroforesi su gel 1D e 2D è che l'elettroforesi su gel 1D separa le proteine in base solo al peso molecolare mentre l'elettroforesi su gel 2D separa le proteine in base sia al punto isoelettrico che al peso molecolare. A causa di questa differenza fondamentale tra l'elettroforesi su gel 1D e 2D, anche la risoluzione della separazione delle proteine e il costo delle due tecniche variano. L'elettroforesi su gel 2D mostra un'elevata risoluzione rispetto all'elettroforesi su gel 1D. Tuttavia, l'elettroforesi su gel 2D è più costosa dell'elettroforesi su gel 1D.
Qui sotto l'infografica riassume la differenza tra l'elettroforesi su gel 1D e 2D.
Riepilogo – Elettroforesi su gel 1D vs 2D
La separazione delle proteine dipende da molti fattori. L'elettroforesi su gel 1D separa le proteine in base solo al peso molecolare. Tuttavia, l'elettroforesi su gel bidimensionale o 2D aumenta la risoluzione della separazione delle proteine. Inoltre, l'elettroforesi su gel 2D separa le proteine in base al punto isoelettrico e al peso molecolare. Pertanto, questi dati sono importanti per l'elaborazione a valle delle proteine e nel campo della proteomica. Quindi, questo è il riassunto della differenza tra l'elettroforesi su gel 1D e 2D.
