La differenza chiave tra il gene candidato e GWAS è che l'approccio del gene candidato studia la variazione genetica all'interno di un piccolo numero di geni di interesse pre-specificati mentre GWAS studia l'intero genoma per una variazione genetica comune dietro una particolare condizione di malattia.
L'approccio del gene candidato e gli studi di associazione sull'intero genoma (GWAS) sono due metodi importanti per rilevare la suscettibilità genetica alle malattie. L'approccio del gene candidato si basa su un piccolo numero pre-specificato di geni mentre GWAS si basa sul test dell'intero genoma. Pertanto, l'approccio del gene candidato richiede una conoscenza preliminare dei geni rilevanti per la malattia, a differenza del GWAS.
Cos'è il gene candidato?
L'approccio del gene candidato è una delle tecniche che studia l'associazione tra variazione genetica all'interno di geni di interesse pre-specificati e fenotipi o stati patologici. In questo approccio, è necessario avere una conoscenza preliminare dell'impatto funzionale biologico del gene sul tratto o sulla malattia in questione. Sulla base di questa conoscenza, un piccolo numero di geni viene selezionato e analizzato per la variazione genetica.
Figura 01: Approccio al gene candidato
La selezione dei geni viene effettuata in base alla rilevanza biologica, fisiologica e funzionale per la malattia in questione in questo approccio. Questo approccio è spesso concepito come uno studio caso-controllo.
Cos'è GWAS?
GWAS sta per Genome-Wide Association Study. Si riferisce anche a studi di associazione sull'intero genoma. Questi studi si concentrano principalmente su studi osservazionali. Analizzano le varianti genetiche di diversi individui solitamente associate a un tratto specifico. L'intero genoma è importante per l'analisi GWAS.
GWAS è uno strumento importante nell'analisi dei polimorfismi a singolo nucleotide associati a varie condizioni patologiche. È uno studio comparativo dei diversi polimorfismi a singolo nucleotide in un'ampia popolazione. Il campione di studio di GWAS è molto alto; quindi, assume anche il formato di uno studio di coorte trasversale.
Figura 02: GWAS
Il primo studio GWAS ha avuto luogo per quanto riguarda l'infarto del miocardio e l'analisi dei geni associati all'infarto del miocardio. Attualmente, GWAS svolge un ruolo importante nel determinare il background genetico di malattie complesse con eziologia sconosciuta.
Quali sono le somiglianze tra il gene candidato e GWAS?
- Sia l'approccio del gene candidato che il GWAS sono tecniche che analizzano l'associazione genetica tra genotipo e fenotipo della malattia.
- Entrambi gli approcci aiutano a comprendere le basi genetiche della suscettibilità alle malattie.
Qual è la differenza tra il gene candidato e GWAS?
L'approccio del gene candidato si basa sui geni candidati o sui geni pre-specificati, mentre GWAS si basa sull'intero genoma. Quindi, questa è la differenza chiave tra il gene candidato e GWAS. Inoltre, nell'approccio del gene candidato, la selezione dei geni è necessaria mentre non è necessaria in GWAS.
Inoltre, l'approccio del gene candidato richiede una conoscenza preliminare dei geni rilevanti per la malattia, mentre non è necessario per GWAS.
Qui sotto l'infografica fornisce un confronto più dettagliato relativo alla differenza tra il gene candidato e GWAS.
Riepilogo – Candidate Gene vs GWAS
Candidate gene e GWAS sono due studi di associazione genica. L'approccio del gene candidato si concentra sulla variazione genetica associata alla malattia all'interno di un piccolo numero di geni pre-specificati. Al contrario, GWAS studia la variazione genetica associata alla malattia all'interno dell'intero genoma. Quindi, questa è la differenza chiave tra il gene candidato e GWAS. Entrambi i metodi sono importanti per comprendere le basi genetiche della suscettibilità alle malattie.
