Il differenza fondamentale tra l'aggancio molecolare e il punteggio è quello l'aggancio è una tecnica utilizzata per determinare l'affinità di legame tra due molecole mentre il punteggio è un processo di valutazione di una particolare posa contando il numero di interazioni intermolecolari favorevoli.
I termini docking molecolare e scoring sono usati nel campo della modellazione molecolare. La modellazione molecolare è una tecnica utilizzata per determinare le possibili disposizioni di diverse molecole in una data sostanza. Questa tecnica è importante per creare nuovi composti stabili.
Cos'è l'aggancio molecolare?
L'aggancio molecolare è una simulazione computazionale di un ligando candidato che si lega a un recettore. Questo metodo prevede l'orientamento preferito di una molecola rispetto a un' altra molecola quando legata l'una all' altra per formare un complesso stabile. I risultati ottenuti da questa tecnica possono essere utilizzati per prevedere la forza dell'associazione o l'affinità di legame tra due molecole. Anche qui è importante la funzione di punteggio molecolare.
Figura 01: Un semplice diagramma che mostra il processo delle interazioni molecolari nei sistemi biologici
In genere, questa tecnica considera le molecole biologicamente rilevanti come proteine, peptidi, acidi nucleici, carboidrati e lipidi. Queste molecole sono molto importanti e svolgono un ruolo importante nei meccanismi di trasduzione del segnale nel nostro corpo. Pertanto, l'orientamento delle due molecole che si legheranno per questo processo di trasduzione del segnale influenza il tipo di segnale qui prodotto. Questo significa; l'aggancio molecolare è importante nel determinare sia la forza che il tipo di segnale prodotto durante la trasduzione del segnale nei sistemi biologici.
Inoltre, le tecniche di docking molecolare sono importanti nella progettazione di farmaci basati sulla struttura. Ciò è dovuto alla sua prevedibilità della conformazione del legame di piccole molecole come i ligandi a un sito di legame adatto.
Che cos'è il punteggio molecolare?
Il punteggio molecolare è un tipo di funzione matematica utile per valutare l'andamento dell'aggancio molecolare. Nel campo della chimica computazionale, le funzioni di punteggio vengono utilizzate per prevedere l'affinità di legame tra due molecole dopo il processo di docking. Ad esempio, se abbiamo una piccola molecola di un farmaco particellare e c'è un bersaglio biologico come una proteina, possiamo valutare l'affinità del farmaco verso il sito di legame. Inoltre, il punteggio molecolare può essere utilizzato per predire le interazioni intermolecolari tra due proteine o tra una proteina e molecole di DNA.
Figura 02: Funzione di punteggio in breve
La principale applicazione del punteggio molecolare è nei processi di progettazione dei farmaci, ad esempio screening virtuale, progettazione de novo, ottimizzazione dei lead, ecc.
Qual è la differenza tra docking molecolare e punteggio?
L'aggancio molecolare e il punteggio sono importanti nella modellazione molecolare. Il differenza fondamentale tra l'aggancio molecolare e il punteggio è quello l'aggancio è una tecnica utilizzata per determinare l'affinità di legame tra due molecole mentre il punteggio è un processo di valutazione di una particolare posa contando il numero di interazioni intermolecolari favorevoli.
La seguente infografica riassume la differenza tra docking molecolare e punteggio.
Riepilogo – Aggancio molecolare vs punteggio
L'aggancio molecolare e il punteggio sono importanti nella modellazione molecolare. Il differenza fondamentale tra l'aggancio molecolare e il punteggio è quello l'aggancio è una tecnica utilizzata per determinare l'affinità di legame tra due molecole mentre il punteggio è un processo di valutazione di una particolare posa contando il numero di interazioni intermolecolari favorevoli.
