La differenza chiave tra CRISPR e CRISPR Cas9 è che CRISPR (ripetizione palindromica breve e regolarmente interspaziata in cluster) è un meccanismo di difesa immunitaria procariotica naturale mentre CRISPR cas9 è una nucleasi Cas9 guidata dall'RNA che fa parte dell'adattativo CRISPR sistema immunitario.
CRISPR è un sistema immunitario di difesa antivirale che si trova nei batteri e negli archaea. È una famiglia di sequenze di DNA che si trovano nel genoma batterico. È costituito da sequenze spaziali che derivano da frammenti di DNA di batteriofagi che li avevano precedentemente infettati. Nelle successive infezioni virali, i batteri usano queste sequenze per distruggere il DNA virale. Le sequenze CRISPR hanno brevi ripetizioni palindromiche e sequenze spaziali. Inoltre, le sequenze di spaziatori ripetuti CRISPR hanno spesso geni associati che codificano per le proteine Cas. Cas9 è un'endonucleasi guidata da RNA. Insieme alle sequenze CRISPR, la proteina Cas9 agisce come sistema immunitario adattativo nei batteri contro i batteriofagi.
Cos'è CRISPR?
CRISPR sta per Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats. È un gruppo di sequenze di DNA che si trovano nel genoma batterico. Funziona come meccanismo di difesa naturale nei batteri ed è stato identificato per la prima volta in E. coli. Nei batteri agisce come protezione immunitaria adattativa, in particolare contro i batteriofagi. Pertanto, è un meccanismo specifico della sequenza.
Figura 01: CRISPR
Il sistema CRISPR contiene diverse sequenze ripetute di DNA a segmenti brevi. Queste ripetizioni sono palindromiche, avendo la stessa sequenza di base quando si legge da 5' a 3' mentre l' altra dà la stessa sequenza quando si legge da 3' a 5'. Inoltre, le ripetizioni sono identiche. Si trovano tra brevi sequenze di DNA "distanziatori" che non sono identiche. Ma queste sequenze di DNA spaziatore sono simili o corrispondenti al DNA di batteriofagi estranei. I geni associati a CRISPR sono noti come geni associati a CRISPR o geni Cas. I geni Cas codificano per le proteine Cas che sono elicasi o nucleasi. Le elicasi svolgono il DNA mentre le nucleasi tagliano il DNA. Nel complesso, se si considera il CRISPR, si tratta di un sistema immunitario di batteri che agisce contro i batteriofagi (virus che infettano i batteri).
Cos'è CRISPR Cas9?
La proteina 9 associata a Cas9 o CRISPR è un'endonucleasi batterica guidata da RNA. Pertanto, è un enzima che riconosce e taglia il DNA bersaglio (in particolare il DNA del batteriofago) complementare all'RNA guida. Esegue la scissione specifica del filo. La proteina Cas9 è codificata da un gene associato a CRISPR. CRISPR cas9 è il sistema nucleasi CRISPR-Cas9 guidato dall'RNA che può essere utilizzato come piattaforma di targeting e modifica del DNA programmabile dall'RNA per l'editing del genoma, la perturbazione trascrizionale, la modulazione epigenetica e l'imaging del genoma. Questo sistema CRISPR cas9 è molto popolare negli attuali sistemi di editing del genoma.
Figura 02: CRISPR Cas9
Attualmente, il sistema CRISPR/Cas9 viene utilizzato per alterare o modificare il genoma dei mammiferi mediante repressione o attivazione della trascrizione. Le cellule di mammifero possono rispondere alle rotture del DNA mediate da CRISPR/Cas9 adottando un meccanismo di riparazione. Può essere eseguito utilizzando il metodo di giunzione dell'estremità non omologa (NHEJ) o la riparazione diretta dall'omologia (HDR). Entrambi questi meccanismi di riparazione avvengono introducendo rotture a doppio filamento. Ciò si traduce nell'editing genetico dei mammiferi. NHEJ può portare all'ablazione delle mutazioni geniche e può essere utilizzato per creare una perdita di effetti funzionali. L'HDR può essere utilizzato per introdurre mutazioni puntiformi specifiche o per introdurre segmenti di DNA di lunghezza variabile. Attualmente, il sistema CRISPR/Cas è utilizzato nei campi delle applicazioni terapeutiche, biomediche, agricole e di ricerca.
Quali sono le somiglianze tra CRISPR e CRISPR Cas9?
- Cas9 fa parte del sistema CRISPR Cas.
- Il sistema Crisper cas9 è un sistema immunitario che si trova naturalmente nei batteri.
Qual è la differenza tra CRISPR e CRISPR Cas9?
CRISPR è un cluster di sequenze di DNA presenti nel genoma batterico che funziona come un sistema di difesa naturale contro i batteriofagi. Consiste di brevi ripetizioni palindromiche regolarmente interspaziate, distanziatori e geni associati. Al contrario, cas9 è una proteina 9 associata a CRISPR, che è un enzima endonucleasico guidato dall'RNA. Riconosce e scinde i doppi filamenti di virus del DNA. In effetti, fa parte del sistema di difesa CRISPR. Quindi, questa è la differenza chiave tra CRISPR e CRISPR cas9.
Riepilogo – CRISPR vs CRISPR Cas9
CRISPR Il sistema Cas è un sistema di difesa microbica. CRISPR è un cluster di sequenze di DNA composto da brevi ripetizioni palindromiche, sequenze spaziali e geni associati. Cas9 è una proteina Cas che è un'endonucleasi guidata da RNA. Le proteine CRISPR e Cas9 costituiscono un sistema immunitario che agisce contro le infezioni da batteriofagi nei batteri. La proteina Cas9 è in grado di fendere il DNA virale estraneo e distruggerli. CrRNA guida cas9 a riconoscere il DNA virale. Pertanto, il sistema CRISPR cas9 è un sistema immunitario naturale che si trova nei batteri contro i virus. Quindi, questo è il riassunto della differenza tra CRISPR e CRISPR cas9.
