La differenza fondamentale tra il fattore sigma e il fattore rho è che il fattore sigma è una proteina necessaria per l'inizio della trascrizione nei batteri mentre il fattore rho è una proteina necessaria per la fine della trascrizione nei batteri.
Il fattore Sigma e il fattore rho sono due fattori importanti per la trascrizione batterica. La trascrizione batterica è un processo in cui un pezzo di DNA batterico viene copiato in un nuovo filamento di mRNA (RNA messaggero). Questo processo è catalizzato da un enzima noto come RNA polimerasi. I batteri dipendono fortemente dalla trascrizione e dalla traduzione per rispondere correttamente al loro ambiente. La RNA polimerasi batterica è costituita da un nucleo e una struttura oloenzimatica. Il nucleo contiene le subunità β, β′, α e 2ω mentre l'oloenzima contiene il fattore sigma. Inoltre, un fattore ausiliario all'RNA polimerasi noto come fattore rho è anche molto importante per la trascrizione batterica.
Cos'è il Sigma Factor?
Il fattore Sigma o fattore di specificità è una proteina necessaria per l'inizio della trascrizione nei batteri. È un fattore di inizio della trascrizione batterica. Questo fattore consente il legame dell'enzima RNA polimerasi a una regione specifica del DNA chiamata regione del promotore durante la trascrizione. Il fattore Sigma è normalmente omologo al fattore di trascrizione arcaico B e al fattore di trascrizione eucariotico TF11B. Inoltre, il fattore sigma specifico di un dato gene varia a seconda del gene e dei segnali ambientali. I promotori sono selezionati dalla RNA polimerasi in base al fattore sigma ad essa associato.
Figura 01: Fattore Sigma
Il fattore sigma si trova anche nel cloroplasto delle piante come parte della polimerasi codificata con plastidi (PEP). Il fattore sigma e l'RNA polimerasi complessivamente sono noti come oloenzima RNA polimerasi. Il peso molecolare del fattore sigma è di circa 70 kDa. Dopo l'inizio della trascrizione, il fattore sigma si dissocia dal complesso. Quindi la RNA polimerasi continua l'allungamento fino al termine della trascrizione.
Cos'è il fattore Rho?
Il fattore Rho è una proteina procariotica coinvolta nella terminazione della trascrizione. Il fattore Rho di solito si lega al sito di pausa del terminatore della trascrizione. Questo sito è una regione esposta dell'RNA a filamento singolo vicino al frame di lettura aperto a sequenze povere di guanina ricche di citosina. È una proteina di trascrizione essenziale nei procarioti. In Escherichia coli, il fattore rho è di circa 274,6 kDa esamero di subunità identiche. Ogni subunità ha un dominio di legame dell'RNA e un dominio di idrolisi dell'ATP. Inoltre, la funzione del fattore rho è l'attività dell'elicasi.
Figura 02: Fattore Rho
Il fattore Rho si lega alla molecola di RNA e quindi utilizza la sua attività ATPasi per fornire energia per traslocare le molecole di RNA. Il fattore Rho effettua la traslocazione fino a raggiungere la regione elicoidale dell'RNA-DNA, dove svolge la struttura duplex ibrida (RNA-DNA). Questo processo sospende l'RNA polimerasi nel sito di terminazione terminando il processo di trascrizione.
Quali sono le somiglianze tra il fattore Sigma e il fattore Rho?
- Il fattore Sigma e il fattore rho sono due fattori importanti per la trascrizione batterica.
- Entrambi sono presenti solo nei procarioti.
- Sono proteine costituite da aminoacidi.
- Entrambi sono proteine che legano gli acidi nucleici.
- I procarioti fanno molto affidamento su questi fattori per generare mRNA che possono produrre proteine peculiari e aiutarli a rispondere in modo specifico al loro ambiente.
Qual è la differenza tra il fattore Sigma e il fattore Rho?
Il fattore Sigma è una proteina necessaria per l'inizio della trascrizione nei batteri, mentre il fattore rho è una proteina necessaria per la fine della trascrizione nei batteri. Quindi, questa è la differenza chiave tra il fattore sigma e il fattore rho. Inoltre, il fattore sigma è una proteina legante il DNA, mentre il fattore rho è una proteina legante l'RNA.
L'infografica qui sotto presenta le differenze tra il fattore sigma e il fattore rho in forma tabellare per un confronto fianco a fianco.
Riepilogo – Fattore Sigma vs Fattore Rho
La trascrizione è il processo in cui le informazioni nel DNA vengono copiate in una nuova molecola chiamata mRNA (RNA messaggero). Questo m-RNA è infine coinvolto nella produzione di una specifica proteina. Il fattore Sigma e il fattore rho sono due fattori importanti per la trascrizione batterica. Sono proteine. Il fattore Sigma partecipa all'inizio della trascrizione nei batteri. Il fattore Rho è responsabile della cessazione della trascrizione nei batteri. Quindi, questo è il riassunto della differenza tra il fattore sigma e il fattore rho.
