La differenza fondamentale tra Cosmid e Phagemid sta nel tipo di sequenze che contiene. Un cosmide contiene un cos sito e un plasmide. Pertanto, è un vettore ibrido mentre un fagemide è un plasmide che contiene un'origine F1 di replicazione del fago F1.
Cosmidi e fagemidi sono usati per scopi di clonazione, in particolare per clonare frammenti più grandi di DNA. Questi sono ampiamente utilizzati soprattutto nella clonazione di geni responsabili della produzione di varie proteine. Cosmidi e fagemidi vengono replicati da soli come plasmidi oppure impacchettati in particelle virali e quindi replicati.
Cos'è un Cosmid?
A Cosmid, indicato come plasmide ibrido, comprende siti cos estratti da particelle di fago Lambda e un plasmide. Questi siti cos sono lunghi frammenti di DNA con 200 paia di basi. Quindi, hanno estremità coesive o appiccicose che consentono al plasmide di adattarsi al DNA virale. Pertanto, i siti cos sono vitali per il confezionamento del DNA.
Ci sono tre siti cos;
- sito cosN – coinvolto nella scalfittura del filamento di DNA da parte dell'attività di terminasi
- cosB sito – impegnato nel mantenimento della terminazione.
- sito cosQ – coinvolto nella prevenzione della degradazione del DNA da parte delle DNasi.
Figura 01: Cosmid
Inoltre, i cosmidi possono replicare il DNA a filamento singolo o il DNA a doppio filamento utilizzando un'origine di replicazione adeguata. I cosmidi di solito contengono geni di resistenza agli antibiotici come marcatori per la selezione dei trasformanti. Pertanto, l'uso di un cosmide come vettore può facilitare la clonazione e l'enzima di restrizione digestione del vettore può quindi estrarre questi frammenti.
Cos'è un fagemide (fasmide)?
Phagemid, chiamato anche Phasmid, è anche un tipo di vettore ibrido. Phagemid contiene un'origine speciale di replicazione definita come l'origine f1 della replicazione. L'origine f1 della replicazione estrae da un fago f1.
Phagemid può replicare sia il DNA a filamento singolo che quello a doppio filamento. La replicazione può avvenire come plasmide mentre è in fase di replicazione indipendente o può essere impacchettata in particelle fagiche e infine infettare l'ospite batterico E coli. Quando infetta le cellule E coli, il fago f1 richiede la presenza di un pilus. Quindi, i pili sessuali sono importanti durante il confezionamento in vitro di Phagemids.
Quali sono le somiglianze tra Cosmide e Fagemide?
- Sia Cosmid che Phagemid sono vettori di clonazione utilizzati nella tecnologia del DNA ricombinante.
- Cosmid e Phagemid possono replicare DNA a filamento singolo e doppio.
- Entrambi possono subire una replicazione indipendente simile ai plasmidi.
- Cosmid e Phagemid possono essere sottoposti a confezionamento in vitro e infettare le cellule batteriche.
- Sia Cosmid che Phagemid richiedono un'origine di replicazione adeguata per la clonazione.
Qual è la differenza tra cosmide e fagemide?
Cosmid vs Phagemid |
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| Il cosmide è un vettore ibrido che contiene un sito cos e un plasmide. | Il fagemide è un plasmide che contiene un'origine F1 di replicazione del fago F1. |
| Presenza di siti Cos | |
| I siti Cos sono presenti nel cosmide e sono necessari per il confezionamento in vitro. | I siti Cos sono assenti in phagemid. |
| Presenza di F1 Origine della replica | |
| Nel cosmide, l'origine della replicazione può essere presente o meno. | L'origine della replicazione F1 è presente nel fagemide. |
| Presenza di geni resistenti agli antibiotici | |
| I geni resistenti agli antibiotici sono presenti nei cosmidi per identificare i trasformanti dai non trasformanti. | I geni resistenti agli antibiotici sono assenti nei fagemidi. |
| Requisito di imballaggio in vitro | |
| Richiede un sito cos. | Richiede un pilus sessuale. |
Riepilogo – Cosmid vs Phagemid
Cosmid e Phagemid sono vettori di clonazione utilizzati nella tecnologia del DNA ricombinante. I cosmidi sono vettori ibridi che contengono speciali estremità adesive note come siti cos. l'imballaggio in vitro richiede questi siti cos. Mentre i fagemidi sono plasmidi che contengono un'origine f1 di replicazione estratta dal fago f1. Sia il cosmide che il fagemide possono subire una replicazione indipendente o un confezionamento in vitro in cellule batteriche. Queste sono le differenze importanti tra cosmide e fagemide.
