Differenza tra proteomica e metabolomica

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Differenza tra proteomica e metabolomica
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Video: Le analisi metabolomiche: vantaggi e interpretazioni - intervista al Dott. Dimitris Tsoukalas 2024, Luglio
Anonim

La differenza fondamentale tra proteomica e metabolomica è che la proteomica è lo studio di tutte le proteine di un organismo mentre la metabolomica è lo studio di tutti i metaboliti di un organismo.

La genomica è lo studio della composizione genetica di un organismo. La proteomica e la metabolomica sono due scienze omiche legate alla genomica. Il proteoma si riferisce a tutte le proteine in una cellula o in un organismo. Il metaboloma, d' altra parte, si riferisce a tutti i metaboliti di un organismo. Pertanto, lo studio del proteoma è la proteomica mentre lo studio del metaboloma è la metabolomica. Sia la proteomica che la metabolomica sono importanti nella diagnostica delle malattie e nella caratterizzazione e screening degli organismi. Inoltre, entrambi sono collegati in molti aspetti della biologia cellulare, in particolare nella segnalazione cellulare, nella degradazione e generazione delle proteine e nella modifica post-traduzionale.

Cos'è la proteomica?

Il proteoma è il complemento proteico totale in una cellula, un tessuto o un organismo. Pertanto, la proteomica è lo studio del proteoma di un organismo. In proteomica vengono analizzate diverse caratteristiche delle proteine. Pertanto, la proteomica si concentra principalmente sulla struttura, l'orientamento, le funzioni, le interazioni proteiche, le modifiche, le applicazioni e l'importanza delle proteine. Ecco perché attualmente molti progetti di ricerca sono condotti nel campo della proteomica.

Sono stati condotti i primi studi proteomici per identificare il contenuto proteico in Escherichia coli. La mappatura del contenuto proteico totale è stata eseguita utilizzando gel bidimensionali (2D). Dopo il successo di questo progetto, gli scienziati sono passati alla caratterizzazione del contenuto proteico totale in animali come cavie e topi. Al momento, la mappatura delle proteine umane viene eseguita utilizzando l'elettroforesi su gel 2D.

Ci sono molti vantaggi nello studio della proteomica poiché le proteine sono le molecole che governano la maggior parte dell'attività a causa della proprietà catalizzatrice delle proteine. Pertanto, lo studio delle proteine intere può fornire informazioni sullo stato di salute di un organismo. Inoltre, la proteomica ha molte applicazioni nell'annotazione del genoma, nell'identificazione e nella diagnostica di malattie, nello svolgimento di studi sull'espressione proteica durante la sperimentazione e nelle modifiche proteiche e negli studi di interazione, ecc.

Differenza tra proteomica e metabolomica
Differenza tra proteomica e metabolomica

Figura 01: Proteomica

Ci sono diverse tecniche coinvolte nella proteomica, inclusa l'estrazione della proteina totale, la loro separazione mediante elettroforesi su gel 2D, il sequenziamento delle proteine estratte mediante metodi come il metodo di sequenziamento di Edmund o la spettrometria di massa e l'analisi strutturale e funzionale proprietà della proteina utilizzando software basati su computer e strumenti bioinformatici.

Cos'è la Metabolomica?

La metabolomica è lo studio di tutti i metaboliti in una cellula, un tessuto o un organismo. Comprende l'identificazione e la quantificazione dei metaboliti cellulari utilizzando diversi strumenti analitici e statistici avanzati. La metabolomica è uno studio importante poiché rivela informazioni riguardanti il metabolismo di un organismo.

Differenza tra proteomica e metabolomica
Differenza tra proteomica e metabolomica

Figura 02: Metabolomica

Per studiare substrati e prodotti delle reazioni metaboliche, la metabolomica utilizza la spettrometria di massa come piattaforma analitica. La spettrometria di massa determina i metaboliti e le loro concentrazioni, riflettendo lo stato biochimico effettivo delle cellule o dei tessuti. Quindi, la metabolomica può essere considerata come la migliore rappresentazione del fenotipo molecolare di un organismo. Oltre a questi, la metabolomica può essere considerata un'estensione della proteomica perché la maggior parte dei metaboliti sono generati dall'attività degli enzimi che sono proteine.

Quali sono le somiglianze tra proteomica e metabolomica?

  • Proteomica e metabolomica sono due scienze omiche legate alla genomica.
  • La metabolomica può essere considerata un'estensione della proteomica.
  • Proteoma e metaboloma sono strettamente intrecciati con molti studi.

Qual è la differenza tra proteomica e metabolomica?

La proteomica è lo studio su larga scala delle proteine, compresa la loro struttura e funzione, all'interno di una cellula o di un organismo. Nel frattempo, la metabolomica è lo studio dei profili dei metaboliti in una cellula, un tessuto o un organismo in un determinato insieme di condizioni. Quindi, questa è la differenza chiave tra proteomica e metabolomica. Inoltre, la proteomica riguarda principalmente l'insieme completo di proteine, mentre la metabolomica riguarda principalmente l'insieme completo di metaboliti, inclusa una vasta gamma di piccole molecole come peptidi, carboidrati, lipidi, nucleosidi e prodotti catabolici di composti esogeni, ecc. Pertanto, questa è un' altra differenza tra proteomica e metabolomica.

L'infografica qui sotto riassume la differenza tra proteomica e metabolomica.

Differenza tra proteomica e metabolomica in forma tabulare
Differenza tra proteomica e metabolomica in forma tabulare

Riepilogo – Proteomica vs Metabolomica

Gli organismi viventi possono essere studiati utilizzando il loro genoma, proteine e metaboliti. Genomica, proteomica e metabolomica sono le tre aree che studiano rispettivamente la composizione genetica, le proteine ei metaboliti di una cellula o di un organismo. La proteomica è importante poiché è un riflesso dinamico sia dei geni che dell'ambiente. La metabolomica è molto importante poiché riflette direttamente lo stato attuale della reazione biochimica delle cellule o lo stato metabolico di un organismo. Quindi, questo riassume la differenza tra proteomica e metabolomica.

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