La differenza chiave tra proteomica mirata e non mirata è che la proteomica mirata mira a misurare l'abbondanza di una specifica proteina mentre la proteomica non mirata non mira a una proteina specifica.
La proteomica è lo studio su larga scala delle proteine, delle loro strutture e funzioni. Studia l'intero complemento proteico in una cellula, un tessuto o un organismo in condizioni specifiche. Esistono due tipi di proteomica: proteomica mirata e proteomica non mirata.
Cos'è la proteomica mirata?
Come indica il nome, la proteomica mirata prende di mira una specifica proteina o un peptide in una complessa miscela di proteine per l'analisi. Quindi analizza la presenza e la quantità di quella specifica proteina preselezionata. Questo metodo è possibile per un solo campione o per più campioni. Questo metodo è adatto anche per un gruppo specifico di proteine. Ne risultano dati più precisi, quantitativi e sensibili. Inoltre, la spettrometria di massa accoppiata con la proteomica mirata produce misurazioni affidabili più accurate. Questo metodo utilizza lo spettrometro di massa a triplo quadrupolo (QQQ) per la sua analisi.
Figura 01: Proteomica
La proteomica mirata è un metodo adatto se si desidera verificare se un bersaglio knockdown è effettivamente abbattuto o quando si desidera quantificare una particolare proteina/peptide nel siero del sangue, nel fluido cerebrale o nel lisato cellulare ecc. Puoi anche usalo se vuoi verificare se una particolare proteina è espressa in modo differenziato tra i campioni o durante un esperimento con decorso temporale.
Cos'è la proteomica non mirata?
La proteomica non mirata, come dice il nome, non prende di mira una specifica proteina o peptide per la sua analisi. Discovery proteomics è un altro nome per proteomica non mirata. In re altà, è un'analisi più "globale". In generale, eseguire una proteomica non mirata significa rispondere alla domanda "quali proteine o proteine ci sono in questo campione o in più campioni?". Questo metodo non è sensibile come proteomica mirata. Ma può identificare e misurare molte proteine, comprese nuove proteine. La proteomica non mirata può produrre misurazioni sia quantitative che qualitative.
Quali sono le somiglianze tra proteomica mirata e non mirata?
- Sia la proteomica mirata che non mirata misurano le proteine nei campioni.
- Sono importanti nell'analisi del proteoma.
- Questi metodi utilizzano la spettrometria di massa.
Qual è la differenza tra proteomica mirata e non mirata?
In primo luogo, la proteomica mirata è la determinazione della presenza e della quantità di una particolare proteina o peptide in una complessa miscela di proteine. Al contrario, la proteomica non mirata è lo studio quantitativo e qualitativo delle proteine presenti in uno o più campioni senza prendere di mira una particolare proteina. La proteomica mirata viene eseguita con proteine preselezionate o mirate mentre la proteomica non mirata viene eseguita per scoprire i tipi di proteine in questo campione. Inoltre, la proteomica mirata è più sensibile della proteomica non mirata.
Riepilogo – Proteomica mirata e non mirata
Riassumendo, la proteomica mirata e quella non mirata sono due tipi di studi sulle proteine. Come suggeriscono i loro nomi, la proteomica mirata prende di mira una proteina specifica mentre la proteomica non mirata non prende di mira una proteina specifica. Questa è la differenza tra proteomica mirata e non mirata.
