La differenza fondamentale tra cis e trans splicing è che cis splicing è un meccanismo intramolecolare che rimuove gli introni e unisce gli esoni che si trovano all'interno dello stesso trascritto di RNA, mentre il trans- splicing è un meccanismo intermolecolare che rimuove introni o outroni e si unisce agli esoni che non sono all'interno della stessa trascrizione di RNA.
Lo splicing dell'RNA è una forma di elaborazione dell'RNA prima della sintesi proteica. In questo processo, una nuova trascrizione di RNA pre-messaggero viene trasformata in un RNA messaggero maturo. L'RNA messaggero maturo aiuta a produrre una molecola proteica. Durante lo splicing dell'RNA, gli introni (regioni non codificanti) vengono rimossi e gli esoni (regioni codificanti) vengono uniti per formare mRNA maturo. Cis e trans splicing sono due tipi di meccanismi di splicing dell'RNA.
Cos'è lo splicing Cis?
Cis splicing è un meccanismo intramolecolare che rimuove gli introni e unisce gli esoni che si trovano all'interno dello stesso trascritto di RNA. Il normale splicing cis elabora una singola molecola di RNA. Lo splicing cis è il tipico processo di splicing del pre mRNA effettuato dagli spliceosomi. Nell'introne, un sito donatore (estremità 5' dell'introne), un sito di diramazione (vicino all'estremità 3' dell'introne) e un sito accettore (estremità 3' dell'introne) sono estremamente essenziali per lo splicing. Il sito donatore di giunzione include una sequenza invariante GU all'estremità 5' dell'introne. Il sito dell'accettore di giunzione all'estremità 3' dell'introne ha una sequenza AG invariante. A monte della sequenza AG, c'è una regione chiamata regione pirimidinica (tratto polipirimidinico). Più a monte del tratto polipirimidinico, c'è un punto di diramazione che include un nucleotide di adenosina. Questo nucleotide è coinvolto nella formazione del lariat.
Figura 01: Cis e Trans Splicing
I principali spliceosomi sono U1, U2, U4, U5 e U6. Tra questi, U1 e U2 sono molto importanti. Nello splicing cis, l'U1 si lega al sito di giunzione 5' e l'U2 si lega al punto di diramazione vicino al sito di giunzione 3'. U5/U4/U6 lega gli esoni al sito 5', con U6 che lega gli U2. Successivamente, gli U1 vengono rilasciati. L'U5 si sposta dall'esone all'introne e l'U6 si lega al sito di giunzione 5'. Inoltre, viene rilasciato anche U4. U6/U2 catalizza la transesterificazione, facendo legare l'estremità 5' dell'introne al nucleotide A sull'introne. Questo innesca la formazione di lariat. Nella formazione di un lariat, l'U5 lega l'esone al sito di giunzione 3' e il sito 5' viene scisso. Nella fase finale dello splicing, U2/U5/U6 rimangono legati al lariat e il sito 3' viene tagliato. In aggiunta a ciò, in questa fase gli esoni vengono legati utilizzando l'idrolisi dell'ATP.
Cos'è Trans Splicing?
Lo splicing trans è un meccanismo intermolecolare che rimuove introni o outroni e unisce gli esoni che non sono all'interno dello stesso trascritto di RNA. Nel trans-splicing, non esiste un sito di giunzione 5' sulla molecola del pre mRNA per il legame della proteina U1. Invece, l'RNA del leader di giunzione con cappuccio (SL) viene trasgiunto in sequenza nell'outron.
Figura 02: giunzione trans
Outron è una regione del pre mRNA tra il cappuccio 5' e il sito di giunzione trans. Tuttavia, la proteina U2 si lega solitamente al sito di giunzione 3'. Dopo aver rimosso l'outron, l'esone leader di giunzione (SL) viene unito al primo esone sul pre mRNA. Inoltre, il trans-splicing è un meccanismo che si osserva in alcuni microrganismi come i protisti della classe Kinetoplastae per esprimere i geni.
Quali sono le somiglianze tra Cis e Trans Splicing?
- Cis e trans splicing sono due tipi di meccanismi di splicing dell'RNA.
- In entrambi i meccanismi, gli introni vengono rimossi.
- Inoltre, in entrambi i meccanismi, gli esoni si uniscono per formare mRNA maturo.
- Entrambi i meccanismi si trovano negli eucarioti.
- Questi meccanismi sono assenti nei procarioti.
Qual è la differenza tra Cis e Trans Splicing?
Cis splicing è un meccanismo intramolecolare che rimuove gli introni e unisce gli esoni che si trovano all'interno dello stesso trascritto di RNA, mentre il trans-slicing è un meccanismo intermolecolare che rimuove introni o outroni e unisce gli esoni che non sono all'interno dello stesso RNA trascrizione. Quindi, questa è la differenza chiave tra cis e trans splicing. Inoltre, nello splicing cis, gli introni vengono rimossi per formare mRNA maturo. D' altra parte, nel trans splicing gli introni o gli outroni vengono rimossi per formare mRNA maturo.
La seguente infografica elenca le differenze tra cis e trans splicing in forma tabellare per un confronto affiancato.
Riepilogo – Cis vs Trans Splicing
Lo splicing dell'RNA è una forma di elaborazione dell'RNA prima del processo di sintesi proteica. Cis e trans splicing sono due tipi di meccanismi di splicing dell'RNA che si trovano negli eucarioti. Lo splicing cis è un meccanismo intramolecolare che rimuove gli introni e unisce gli esoni che si trovano all'interno della stessa trascrizione di RNA, mentre il trans-splicing è un meccanismo intermolecolare che rimuove gli introni o gli outroni e unisce gli esoni che non sono all'interno della stessa trascrizione di RNA. Quindi, questo conclude la discussione sulla differenza tra cis e trans splicing.
