La differenza fondamentale tra CDS e cDNA è che CDS o sequenza codificante è la parte di una trascrizione che viene effettivamente tradotta in proteina mentre la sequenza di cDNA è una sequenza di DNA derivata dall'mRNA mediante trascrizione inversa.
Un gene è una sequenza nucleotidica che codifica per una proteina. È costituito da diverse regioni come regione del promotore, sito di inizio della trascrizione, esoni, codone di inizio, introni e codone di arresto. Pertanto, un gene ha sia sequenze codificanti che non codificanti. Le sequenze di codifica o CDS si riferiscono agli esoni e ai due codoni, che sono il codone di inizio e il codone di arresto. È la sequenza che viene effettivamente tradotta in una proteina. Al contrario, il cDNA è una sequenza di DNA derivata dall'mRNA mediante trascrizione inversa.
Cos'è il CDS?
CDS o sequenza codificante è una parte di un gene che viene effettivamente tradotto in una proteina. Comprende esoni e due codoni come il codone AUG e il codone di arresto. A differenza del cDNA, il CDS non contiene due regioni non tradotte: 5' UTR e 3 UTR. Inoltre, gli introni non sono inclusi in CDS.
Figura 01: Sequenza di codifica
Se confrontate con l'intero genoma e un individuo, le sequenze codificanti sono una piccola frazione. La sequenza codificante è costituita dalla sequenza nucleotidica necessaria per creare la sequenza amminoacidica della proteina.
Cos'è il cDNA?
cDNA o DNA complementare è una sequenza di DNA generata da una sequenza di mRNA. È sintetizzato dal processo chiamato trascrizione inversa. L'enzima trascrittasi inversa catalizza la sintesi del cDNA e la sequenza dell'mRNA funge da modello per la sintesi del cDNA. Fondamentalmente, l'mRNA delle cellule eucariotiche può essere estratto e purificato per produrre cDNA. Dopo aver costruito il cDNA dall'mRNA, possono quindi essere clonati in una cellula batterica per creare librerie di cDNA. Le librerie di cDNA sono importanti per l'analisi delle regioni codificanti, delle funzioni geniche e dell'espressione dei geni, ecc.
Figura 02: cDNA
A differenza della sequenza di codifica, il cDNA contiene due UTR, che sono 3' UTR e 5' UTR. Simile alla sequenza di codifica, il cDNA non contiene introni.
Quali sono le somiglianze tra CDS e cDNA?
- CDS e cDNA sono acidi nucleici.
- Sono costituiti da deossiribonucleotidi.
- Sia CDS che CDNA non contengono introni, che sono regioni non codificanti.
- Entrambi contengono il codice genetico o le informazioni per produrre una proteina.
Qual è la differenza tra CDS e cDNA?
CDS o sequenza codificante è la parte di un gene che viene effettivamente tradotta in una proteina. D' altra parte, la sequenza di cDNA è una sequenza di DNA derivata dall'mRNA mediante trascrizione inversa. Quindi, questa è la differenza chiave tra CDS e cDNA. Inoltre, CDS è costituito da esoni e due codoni, che sono codone di inizio e codone di fine. Al contrario, il cDNA è costituito dalla sequenza completa di mRNA e da due UTR.
Inoltre, la sintesi del cDNA viene eseguita artificialmente dall'mRNA mediante trascrizione inversa mentre i CDS si trovano nel DNA genomico.
Qui sotto l'infografica mostra più confronti per discernere la differenza tra CDS e cDNA.
Riepilogo – CDS vs cDNA
La sequenza codificante e il cDNA sono due tipi di sequenze nucleotidiche. La sequenza di codifica si trova all'interno di un gene mentre il cDNA viene sintetizzato artificialmente. La sequenza di codifica ha esoni e due codoni mentre il cDNA ha una sequenza di mRNA e due UTR. Sia il CDS che il cDNA hanno solo le sequenze nucleotidiche che effettivamente si traducono in una proteina. Non contengono introni. A differenza dei CDS, il processo di sintesi del cDNA richiede l'enzima trascrittasi inversa. Inoltre, il cDNA può essere convertito in librerie di cDNA. Pertanto, questo riassume la differenza tra CDS e cDNA.
