La differenza fondamentale tra il test LAMP e PCR è che LAMP viene condotto a temperatura costante (60-650C) per produrre copie di DNA attraverso l'amplificazione, mentre la PCR viene condotta utilizzando una serie di variazioni di temperatura per produrre copie di DNA mediante amplificazione.
LAMP e PCR sono entrambe tecniche di amplificazione in vitro utilizzate per produrre migliaia di copie di DNA. La quantità di DNA prodotta in LAMP è molto superiore alla quantità prodotta in tecniche PCR come RT-PCR. LAMP è una tecnica più recente rispetto alla tecnica PCR. Ma è tecnicamente semplice e facile per uno scienziato addestrato da eseguire in condizioni di laboratorio. Questo lo rende una tecnica potenzialmente utile per il rilevamento di COVID-19. Tuttavia, RT-PCR è l'attuale test standard per COVID-19. Queste tecniche, sebbene ben note a ricercatori e clinici con un background nell'amplificazione del DNA, potrebbero essere ancora relativamente sconosciute a una comunità più ampia.
Cos'è il test LAMP?
L'amplificazione isotermica mediata da loop (LAMP) per i test COVID-19 inizia con una raccolta di campioni dal naso o dalla gola utilizzando un tampone. I campioni possono anche essere raccolti utilizzando altri metodi come il muco di una forte tosse. Come la tecnica PCR come RT-PCR, l'RNA virale nel campione viene prima convertito in DNA, che ne consente la copia. La reazione LAMP viene condotta a temperatura costante (60-650C).
L'amplificazione del DNA virale che incorpora la tecnologia LAMP e i reagenti può essere rilevata quando la miscela di reazione diventa torbida a causa della produzione di “pirofosfato di magnesio”. Questa nuvolosità consente una facile diagnosi di COVID-19 da parte di scienziati e medici. L'accuratezza dei risultati del test può essere migliorata utilizzando speciali coloranti fluorescenti o coloranti che cambiano colore nella miscela di reazione. Questi coloranti interagiscono con il DNA virale e l'intensità della luce o il cambiamento di colore possono essere misurati per fornire il numero di molecole di RNA virale approssimativamente rispetto a quello inizialmente presente nel campione.
Cos'è il test PCR?
PCR è una tecnica scientifica molto comune che è stata ampiamente utilizzata nella ricerca e nella medicina per 20-30 anni per rilevare il DNA. I test PCR vengono utilizzati direttamente per rilevare un antigene rilevando l'RNA virale. Generalmente, l'RNA virale è presente nel corpo prima di rilevare gli anticorpi o di manifestare i sintomi della malattia. Pertanto, un test PCR può dire se qualcuno ha o meno il virus all'inizio. Attualmente, la PCR è il test standard per rilevare il COVID-19. Esistono diversi tipi di tecniche PCR come PCR in tempo reale, PCR annidata, PCR multiplex, PCR hot start e PCR a lungo raggio, ecc. La PCR utilizza una serie di variazioni di temperatura per produrre copie di DNA attraverso l'amplificazione.
RT-PCR è una versione speciale della tecnica PCR. Viene utilizzato quando viene rilevato l'RNA. Ora è utilizzato per testare COVID-19. La RT-PCR è una tecnica abbastanza sensibile e affidabile. Nella RT-PCR, una volta raccolto un campione, le sostanze chimiche vengono utilizzate per rimuovere proteine, grassi e altre molecole indesiderate, lasciando dietro di sé l'RNA. Gli enzimi del test kit prima convertono l'RNA in DNA, che poi amplifica il DNA virale per rilevare il virus. I coloranti fluorescenti sono tipicamente usati per legarsi al DNA amplificato e produrre luce. Questo può essere letto dalla macchina per produrre il risultato del test.
Quali sono le somiglianze tra il test LAMP e PCR?
- Sono tecniche di amplificazione.
- Entrambi producono DNA copiato.
- Sono tecniche molto sensibili e affidabili rispetto alle tecniche immunitarie come il rilevamento degli anticorpi.
- Sono entrambi utilizzati per i test COVID-19.
Qual è la differenza tra il test LAMP e PCR?
La differenza fondamentale tra i test LAMP e PCR è che, in LAMP, l'amplificazione si ottiene utilizzando una temperatura costante (60-650C), mentre in PCR, il ciclo di le temperature sono richieste. Attualmente sono disponibili diversi tipi di tecniche LAMP. Ma i più importanti per il rilevamento di COVID-19 sono la tecnica isotermica mediata da loop di trascrizione inversa (RT-LAMP) e l'amplificazione mediata da trascrizione (TMA). Inoltre, diversi tipi di tecniche di PCR attualmente disponibili nella pratica clinica per la diagnosi delle malattie come PCR in tempo reale, RT-PCR, PCR annidata, PCR multiplex, PCR hot-start, PCR a lungo raggio, ecc.
L'infografica di seguito elenca le differenze tra il test LAMP e PCR in forma tabellare.
Riepilogo – Test LAMP vs PCR
L'amplificazione isotermica mediata da loop è un processo simile ai test PCR come RT-PCR, ma produce più copie di DNA virale a temperatura costante. Il test di reazione a catena della polimerasi è attualmente la forma di test più comune e standard al mondo per la diagnosi di malattie, come la diagnosi di COVID-19. È considerato abbastanza affidabile. La PCR utilizza una serie di variazioni di temperatura per produrre copie di DNA attraverso l'amplificazione. Pertanto, questo riassume la differenza tra il test LAMP e PCR.
