La differenza chiave tra sequenza conservata e sequenza consenso è quella sequenza conservata si riferisce a sequenze simili di acidi nucleici o amminoacidi che si verificano in specie diverse o uguali nel corso delle generazioni mentre la sequenza consenso è una sequenza nucleotidica comunemente incontrata o una sequenza di amminoacidi trovata in una regione altamente conservata di DNA o RNA o proteine.
Gli organismi condividono caratteristiche simili e diverse. Quando si studiano le relazioni tra organismi e si classificano, il genoma o la composizione genetica degli organismi è molto importante. Ci sono alcune sequenze nucleotidiche o amminoacidiche che sono comuni tra diversi organismi. Una sequenza conservata è un acido nucleico o una sequenza di amminoacidi che è coerente tra le specie. Pertanto, sono filogeneticamente importanti quando si generano alberi filogenetici. Nelle sequenze conservate, ci sono sequenze nucleotidiche specifiche che si trovano più comunemente. Sono conosciute come sequenze di consenso.
Cos'è la sequenza conservata?
Una sequenza conservata è una sequenza di acido nucleico o sequenza di amminoacidi che è simile tra le specie. Pertanto, è coerente tra le specie durante l'evoluzione. Generalmente, queste sequenze sono mantenute dalla selezione naturale. Rimangono invariati molto indietro nell'albero filogenetico. Quindi, le sequenze conservate sono importanti nella costruzione di alberi filogenetici. Si ritiene che le sequenze altamente conservate abbiano spesso un importante valore funzionale. Sono utili anche per identificare malattie genetiche. Tuttavia, le sequenze conservate possono essere sequenze di acidi nucleici codificanti o non codificanti. Inoltre, le sequenze conservate mostrano tassi di mutazione più lenti. Quindi, mostrano cambiamenti minimi nella loro composizione; a volte, non mostrano cambiamenti nel corso delle generazioni.
Figura 01: Sequenza conservata
I componenti dell'RNA dei ribosomi sono presenti in tutti i domini della vita, le sequenze omeobox negli eucarioti e il tmRNA nei batteri sono diversi esempi di sequenze altamente conservate. L'identificazione delle sequenze conservate è facile quando si utilizzano approcci bioinformatici, in particolare lo strumento di allineamento delle sequenze. Inoltre, l'allineamento di sequenze multiple facilita la visualizzazione delle sequenze conservate.
Cos'è la sequenza di consenso?
Una sequenza consenso è una sequenza che si trova comunemente in una data regione conservata di DNA o RNA. È una sequenza nucleotidica molto specifica. Ad esempio, c'è una sequenza consenso a -10 come TATAAT (pribnow box) nei promotori di E. coli, che sono sequenze altamente conservate. Allo stesso modo, c'è un' altra sequenza di consenso: TTGACA anche nei promotori di E. coli a -35. Le sequenze di consenso sono anche conosciute come "scatole".
Figura 02: Sequenza del consenso
Oltre al DNA e all'RNA, le proteine hanno anche sequenze consenso di amminoacidi. I siti di legame proteico sono spesso rappresentati da sequenze consenso. Anche gli enzimi di restrizione hanno sequenze consenso. Inoltre, i siti di giunzione sono anche sequenze consenso. Simile alle sequenze conservate, le sequenze consenso possono essere calcolate e visualizzate da strumenti bioinformatici.
Quali sono le somiglianze tra la sequenza conservata e quella del consenso?
- Le sequenze conservate e di consenso sono sequenze di acidi nucleici o aminoacidi comuni tra le specie.
- Sia le sequenze conservate che quelle di consenso possono essere visualizzate dagli strumenti bioinformatici.
- Sono ampiamente utilizzati in biologia molecolare.
Qual è la differenza tra sequenza conservata e sequenza di consenso?
La sequenza conservata è un acido nucleico o una sequenza di amminoacidi che è coerente tra le specie mentre le sequenze consenso sono basi o amminoacidi molto specifici e comunemente trovati in una data regione conservata. Quindi, questa è la differenza chiave tra sequenza conservata e sequenza consenso. Inoltre, un' altra differenza tra la sequenza conservata e quella di consenso è che le sequenze conservate sono filogeneticamente importanti mentre le sequenze di consenso sono spesso siti di legame alle proteine, siti di splicing, siti di taglio degli enzimi di restrizione, ecc.
Riepilogo – Sequenza conservata vs consenso
Le sequenze conservate sono le sequenze di acidi nucleici o proteine che sono simili tra le specie viventi. Un promotore, un sito di legame del ribosoma, un'origine della replicazione e una sequenza di amminoacidi della proteina istonica sono diversi esempi di sequenze conservate. Al contrario, le sequenze consenso sono basi o amminoacidi specifici che si trovano più comunemente in una data sequenza conservata. -10 box, -35 box di promotore di E. coli, siti di legame alle proteine, siti di splicing e siti di riconoscimento degli enzimi di restrizione sono diversi esempi di sequenze consenso. Quindi, questo è il riassunto della differenza tra sequenza conservata e sequenza consenso.
