La differenza chiave tra la DNA ligasi T4 e la DNA ligasi di E. coli è che la DNA ligasi T4 è un enzima isolato dal batteriofago T4 mentre la DNA ligasi di E. coli è un enzima che è isolato dal batterio E. coli.
DNA ligasi è un tipo specifico di enzima che facilita l'unione di filamenti di DNA attraverso la formazione di un legame fosfodiestere. Svolge un ruolo importante riparando le rotture a filamento singolo e le rotture a doppio filamento nel DNA degli organismi viventi. Inoltre, la DNA ligasi viene utilizzata sia nella riparazione del DNA che nella replicazione del DNA. Oltre agli usi di cui sopra, la DNA ligasi ha anche un ampio uso negli esperimenti di biologia molecolare come la tecnologia del DNA ricombinante. La DNA ligasi T4 e la DNA ligasi di E. coli sono due tipi di enzimi della DNA ligasi.
Cos'è la DNA ligasi T4?
T4 ligasi è un enzima che unisce il DNA che è isolato dal batteriofago T4. Il batteriofago T4 è un virus che infetta l'Escherichia coli. L'enzima T4 ligasi è la DNA ligasi più comunemente usata nella ricerca di laboratorio di biologia molecolare. Normalmente, la ligasi T4 catalizza l'unione di due filamenti coesivi o smussati di DNA a doppio filamento tra i gruppi 5' fosfato e 3' idrossile dei nucleotidi adiacenti. Può anche catalizzare l'unione di RNA a un filamento di DNA o RNA in una molecola duplex. Tuttavia, questo enzima non si unirà agli acidi nucleici a filamento singolo. Inoltre, può anche legare il DNA con estremità smussata con un'efficienza molto maggiore rispetto alla DNA ligasi di E. coli.
Figura 01: DNA ligasi T4
Questo enzima richiede ATP come cofattore. Alcuni esperimenti di ricerca di ingegneria genetica hanno già prodotto enzimi DNA ligasi più attivi rispetto alla DNA ligasi T4 di tipo selvaggio. In uno degli approcci, hanno creato una molecola enzimatica di fusione combinando la ligasi del DNA T4 con la molecola p50 o NF-kB. Questo nuovo enzima della ligasi T4 era il 160% più attivo nelle legature a estremità smussata a scopo di clonazione rispetto alla DNA ligasi T4 di tipo selvaggio. Inoltre, la temperatura ottimale per la DNA ligasi T4 per catalizzare la reazione di ligasi in modo più preciso è 16 °C.
Cos'è la DNA ligasi di E Coli?
E. coli DNA ligasi è un enzima isolato dai batteri E. coli. Il gene responsabile della produzione della DNA ligasi di E. coli è il gene lig. Il DNA di E. coli, la ligasi e la maggior parte delle ligasi del DNA dei procarioti, utilizzano l'energia acquisita dal NAD (nicotinamide adenina dinucleotide) per creare il legame fosfodiestere.
Figura 02: E. Coli DNA ligasi
E. coli DNA ligasi è un enzima di legatura che può unire frammenti di DNA catalizzando la formazione di legami fosfodiestere tra frammenti di DNA a doppio filamento contenenti 5' terminali fosfato e 3' terminali idrossilici. Inoltre, non lega il DNA con estremità smussata se non in condizioni speciali come l'affollamento molecolare con polietilenglicole. Inoltre, non può unire efficientemente l'RNA al DNA. Inoltre, l'attività della DNA ligasi di E. coli può essere potenziata dalla presenza di DNA polimerasi 1 alla giusta concentrazione. Tuttavia, quando la concentrazione dell'enzima DNA polimerasi 1 è più alta, ha effetti negativi sull'attività della DNA ligasi di E. coli.
Quali sono le somiglianze tra la DNA ligasi T4 e la DNA ligasi E Coli?
- La DNA ligasi T4 e la DNA ligasi E-coli sono due tipi di enzimi della DNA ligasi.
- Entrambi sono proteine costituite da aminoacidi.
- Questi enzimi catalizzano la formazione di un legame fosfodiestere tra il 5'fosfato giustapposto e il 3'terminale idrossile nel DNA duplex.
- Hanno ampi usi negli esperimenti di biologia molecolare come la tecnologia del DNA ricombinante.
Qual è la differenza tra la DNA ligasi T4 e la DNA ligasi E Coli?
T4 La DNA ligasi è un enzima isolato dal batteriofago T4 mentre la DNA ligasi di E. coli è un enzima isolato dai batteri di E. coli. Pertanto, questa è la differenza chiave tra la DNA ligasi T4 e la DNA ligasi di E. coli. Inoltre, la fonte di energia per la DNA ligasi T4 è l'ATP. D' altra parte, la fonte di energia per la DNA ligasi di E. coli è NAD.
L'infografica qui sotto presenta le differenze tra la DNA ligasi T4 e la DNA ligasi di E coli in forma tabellare per un confronto fianco a fianco.
Riepilogo – T4 DNA Ligase vs E Coli DNA Ligase
T4 DNA ligasi e E. coli DNA ligasi sono due enzimi che catalizzano la formazione di un legame fosfodiestere tra 5'fosfato giustapposto e 3'terminale idrossile nel DNA duplex. La ligasi T4 è un enzima isolato dal batteriofago T4 mentre la DNA ligasi di E. coli è un enzima isolato dai batteri di E. coli. Quindi, questa è la differenza chiave tra la DNA ligasi T4 e la DNA ligasi E coli.
