Trasposon vs Retrotransposon
Trasposoni e retrotrasposoni sono componenti genetiche del DNA e ci sono grandi differenze tra loro. La presenza percentuale di questi materiali genetici varia tra le specie e le loro funzioni determinano il destino dell'organismo con mutazioni e altri cambiamenti fenotipicamente importanti. I trasposoni e i retrotrasposoni sono geni o raccolte di determinati geni situati nei filamenti di DNA e le alterazioni della loro posizione sono state le cause principali di queste conseguenze. Tuttavia, questo articolo intende discutere brevemente le funzioni di questi geni e presenta un confronto tra trasposoni e retrotrasposoni.
Cos'è Transposon?
I trasposoni sono frammenti o segmenti interessanti di DNA con la capacità di cambiare la posizione del filamento di DNA sotto forma di meccanismo taglia e incolla. A causa di questa natura mobile dei trasposoni, questi sono conosciuti come geni s altatori. I trasposoni sono di due tipi principali noti come trasposoni di classe I e trasposoni di classe II. Di solito, il tipo di Classe II viene indicato come i trasposoni e il tipo di Classe I viene indicato come i retrotrasposoni. I processi di taglio e incollaggio dei segmenti mobili di DNA sono regolati dall'enzima trasposasi. L'enzima si lega alle due estremità del trasposone e taglia i legami fosfodiestere del filamento di DNA, isola il trasposone, lo sposta nel sito bersaglio e si lega nella nuova posizione. Tuttavia, questo processo è interessante da capire, poiché alcuni trasposoni possono spostarsi solo in determinate posizioni solo a causa dell'incompatibilità delle sequenze di base con il sito target. I geni con un'estremità di un singolo filamento hanno la stessa sequenza di basi con l' altra estremità dell' altro singolo filamento sono trasposoni con bordi appiccicosi, perché quelli possono legarsi ai siti del filamento di DNA bersaglio con la stessa sequenza di basi delle estremità appiccicose. Tuttavia, questa mobilità dei geni può causare cambiamenti nel genotipo e nel fenotipo dell'organismo. Gli scienziati hanno inventato i trasposoni e sono stati poi messi a disposizione alimenti e organismi geneticamente modificati secondo le personalizzazioni preferite. Colture agricole altamente produttive, antibiotici con proprietà medicinali, animali da allevamento erano alcuni dei prodotti sviluppati vantaggiosamente dopo l'invenzione dei trasposoni da parte di Barbara McClintock negli anni '40.
Cos'è Retrotrasposone?
I retrotrasposoni sono i trasposoni di Classe I e questi si muovono attraverso il genoma attraverso il meccanismo del copia e incolla. Il meccanismo della mobilità dei retrotrasposoni coinvolge alcuni passaggi importanti come la copia del segmento genico del filamento di DNA nell'RNA, il trasferimento della copia dell'RNA al sito target, la trascrizione della sequenza di RNA nel DNA utilizzando la trascrittasi inversa e l'inserimento del gene nella nuova posizione del filamento di DNA del genoma. Le due estremità di questi retrotrasposoni di solito hanno lunghe ripetizioni terminali con circa 1000 paia di basi e quelle sono usate come caratteristiche di identificazione di questi geni. Questi geni sono facilmente amplificabili all'interno del genoma e la percentuale dei retrotrasposoni nel genoma umano è di circa il 50%. Questi potrebbero essere piuttosto pericolosi poiché il virus causativo dell'AIDS, dell'HIV e del virus della leucemia a cellule T ha i retrotrasposoni nei loro genomi di RNA. In effetti, questi virus possono legare i retrotrasposoni in qualsiasi sito dei filamenti di DNA umano con l'uso della trascrittasi inversa e dell'integrasi. L'enzima integrasi funziona allo stesso modo della trasposasi nei trasposoni di Classe II.
Qual è la differenza tra Transposon e Retrotransposon?
• I trasposoni sono geni s altatori di Classe II mentre i retrotrasposoni rientrano nella categoria di Classe I.
• I trasposoni funzionano con l'enzima trasposasi mentre i retrotrasposoni funzionano con l'uso di due enzimi principali noti come trascrittasi inversa e integrasi.
• Le estremità terminali sono molto più lunghe nei retrotrasposoni che nei trasposoni.
• I trasposoni vengono tagliati dall'origine e incollati al bersaglio; al contrario, i retrotrasposoni vengono copiati dall'origine nell'RNA e trascritti al bersaglio.
• Lo spostamento dei retrotrasposoni coinvolge l'RNA ma non nei trasposoni.
