Differenza chiave – DNA a monte e a valle
È importante avere una conoscenza generale della composizione e della struttura del DNA per capire la differenza tra il DNA a monte e quello a valle. Il DNA è composto da catene polinucleotidiche. I nucleotidi sono gli elementi costitutivi che creano catene polinucleotidiche e ogni nucleotide è costituito da tre componenti: uno zucchero a cinque atomi di carbonio, una base azotata e un gruppo fosfato. Un gruppo fosfato e un gruppo OH sono attaccati rispettivamente al carbonio in posizione 5' e al carbonio in posizione 3' della molecola di zucchero in un nucleotide. I nucleotidi sono uniti tra loro da legami fosfodiestere formati tra il gruppo fosfato 5' di un nucleotide e il gruppo 3' OH del nucleotide adiacente. Se una catena polinucleotidica ha un gruppo fosfato 5' libero, viene assegnata come estremità 5'; se ha un gruppo 3' OH libero, viene assegnato come estremità 3'. Pertanto, i filamenti di DNA di solito hanno estremità 5 'e 3' in base alle posizioni finali delle catene polinucleotidiche. Il DNA esiste anche come forma a doppio filamento. Due fili sono antiparalleli tra loro. Pertanto, il DNA ha due filamenti che corrono verso la direzione da 5' a 3' e la direzione da 3' a 5'. Il DNA a monte e a valle è indicato con riferimento alla trascrizione e alla sintesi del filamento di mRNA da 5' a 3'. Se il DNA è considerato verso l'estremità 5 del filamento codificante dal sito di inizio della trascrizione, è noto come DNA a monte. Se il DNA è considerato verso l'estremità 3' dal filamento codificante dal sito di inizio della trascrizione è noto come DNA a valle. Questa è la differenza fondamentale tra il DNA a monte e quello a valle.
Cos'è il DNA a monte?
Un gene è un'eredità di unità strutturale e funzionale che si trova sul DNA di un organismo. Viene memorizzato con le istruzioni per costruire una proteina. Il gene ha una regione specifica di una molecola di DNA. Quando richiesto, trascrive e si traduce in una proteina tramite la sintesi di un filamento di mRNA. Normalmente un filamento codificante del gene va dalla direzione 5' a 3'. Quando viene trascritto, produce un filamento di mRNA nella stessa direzione da 5' a 3'. Durante la trascrizione, il filamento antisenso da 3 'a 5' viene servito come filamento modello e avvia la sintesi dell'mRNA. C'è un sito di inizio della trascrizione nel gene. Con riferimento al sito di inizio della trascrizione, la regione del DNA verso l'estremità 5' del filamento codificante è nota come DNA a monte. Un promotore del gene si trova normalmente nella regione a monte del DNA. Nei geni eucariotici, ci sono scatole TATA, elementi prossimali del promotore e potenziatori nell'area a monte del gene. La regione a monte del gene è indicata con numeri negativi. Il DNA a monte di un gene è della massima importanza per la trascrizione.
Cos'è il DNA a valle?
Il sito di inizio della trascrizione è noto come +1 punto di un gene. La regione del DNA dal punto +1 verso l'estremità 3' del filamento codificante è nota come DNA a valle. In altre parole, a valle del gene è dal sito di inizio della trascrizione verso l'estremità 5' del filamento modello. Pertanto, il DNA a valle di una regione genica include l'unità trascrizionale e altre sequenze come la sequenza del terminatore. Il promotore può influenzare la sequenza a valle di un gene. La parte a valle di un gene viene riferita con numeri positivi. Il DNA a valle di un gene è la regione effettiva che fornisce il prodotto proteico.
Figura 01: DNA a monte ea valle
Qual è la differenza tra il DNA a monte e quello a valle?
Dna a monte vs a valle |
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| La regione del DNA verso l'estremità 5' della sequenza codificante dal sito di inizio della trascrizione è nota come DNA a monte. | La regione del DNA verso l'estremità 3' del filamento codificante dal sito di inizio della trascrizione è nota come DNA a valle. |
| Elementi | |
| Promotori e potenziatori si trovano sul DNA a monte | L'unità di trascrizione e le sequenze del terminatore si trovano nel DNA a valle. |
| Numerazione | |
| I nucleotidi nella regione a monte sono indicati con numeri negativi | I nucleotidi sono indicati con numeri positivi. |
| Funzione | |
| Questa regione contiene elementi necessari per regolamentare e avviare la trascrizione | Questa regione contiene istruzioni per produrre una proteina e terminare la trascrizione |
Riepilogo – DNA a monte e a valle
È facile identificare a monte ea valle di un filamento di RNA. Per quanto riguarda il sito di riferimento, la regione verso l'estremità 5' del filamento di RNA è nota come RNA a monte mentre la regione verso l'estremità 3' è nota come RNA a valle. Tuttavia, nel DNA, ci sono due filamenti che corrono in entrambe le direzioni da 5' a 3' e da 3' a 5'. Quindi, la differenza tra DNA a monte ea valle è complicata. Pertanto, è differenziato con riferimento alla trascrizione di un gene. Dal sito di inizio della trascrizione verso l'estremità 5 del filamento senso, la regione del DNA è nota come DNA a monte mentre dal sito di inizio della trascrizione verso l'estremità 3' del filamento senso è nota come DNA a valle. Questa è la differenza tra monte e valle del DNA.
