La differenza chiave tra knockout genico e knockdown è che il knockout genico è una tecnica in cui il gene di interesse viene completamente rimosso (stato non operativo) per studiare le funzioni del gene mentre il knockdown genico è un' altra tecnica in cui il gene di l'interesse è messo a tacere per indagare il ruolo del particolare gene in un sistema biologico.
Diverse tecniche genetiche sono in uso per studiare il funzionamento dei geni all'interno dei sistemi biologici viventi. Il knockout e il knockdown genico sono due di queste tecniche. Queste tecniche aiutano gli scienziati a identificare gli aspetti funzionali di diversi geni negli organismi viventi.
Cos'è Gene Knockout?
Il knockout genetico è una tecnica genetica che rende inoperanti uno o più geni negli organismi viventi. Questo è anche un processo di spegnimento o eliminazione di un gene di un organismo. L'applicazione principale di questa tecnica è lo studio della funzione genica. Il processo valuta l'effetto del gene perso o rimosso. Il processo di knockout coinvolge anche alcuni enzimi e tecniche di splicing.
Figura 01: Gene Knockout
Ci sono poche variazioni nella tecnica del knockout del gene in base al numero di geni coinvolti. Sono il doppio knockout (knockout di due geni), il knockout triplo (knockout di tre geni) e il knockout quadruplo (knockout di quattro geni). Il knockout genico è ulteriormente classificato in due gruppi; knockout eterozigoti e knockout omozigoti.
Cos'è Gene Knockdown?
Gene knockdown è una procedura sperimentale in cui questa procedura sopprime o riduce l'espressione di un particolare gene o dei geni di un organismo. Il silenziamento genico è la definizione comune di knockdown genico. Durante questa procedura, l'attivazione o la degradazione dell'mRNA prodotto coinvolge l'interferenza dell'RNA (RNAi), il piccolo RNA interferente (siRNA) e l'RNA a forcina corta (shRNA).
Figura 02: Silenziamento genico
L'uso principale del gene knockdown è quello di indagare il ruolo di un particolare gene nel sistema biologico. Pertanto, questa tecnica realizza lo studio degli oncogeni (Bcl-2 e P53) e dei geni che causano malattie neurologiche, infezioni virali e malattie ereditarie.
Quali sono le somiglianze tra Gene Knockout e Knockdown?
- Sia il knockout del gene che il knockdown del gene sono tecniche genetiche.
- Queste due tecniche possono impedire l'espressione genica.
- L'uso principale di entrambe le tecniche è studiare la funzione del gene di interesse.
- Entrambi sono in grado di identificare diverse condizioni patologiche (genetiche).
- Entrambi potrebbero essere utilizzati per uno o più geni di interesse.
Qual è la differenza tra Gene Knockout e Knockdown?
Gene Knockout vs Knockdown |
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| Il knockout genetico è in funzione dei geni (rimozione di geni dal DNA) di un organismo attraverso diverse tecniche genetiche. | Gene knockdown è una procedura sperimentale per sopprimere (ridurre o silenziare) l'espressione di un particolare gene o dei geni di un organismo. |
| Funzione | |
| Facilita lo studio delle funzioni dei geni analizzando i risultati del gene perduto. | Facilita lo studio di oncogeni, geni che causano malattie neurologiche, infezioni virali e malattie ereditarie. |
| Coinvolgimento di agenti RNA | |
| Il coinvolgimento di agenti RNA è insignificante in questa tecnica. | Il processo coinvolge agenti come siRNA, shRNA e RNAi per inattivare l'mRNA. |
| Uso di agenti chimici | |
| Sono utilizzati agenti enzimatici. | Non vengono utilizzati tali agenti chimici. |
| Effetto su Gene | |
| Rimuove completamente il gene dal DNA. | Sopprimi o silenzia il gene. |
| Classificazione | |
| Il doppio knockout, il triplo knockout e il quadruplo knockout e il knockout eterozigote e omozigote sono diversi tipi di knockout genico. | Nessun sistema di classificazione disponibile per il silenziamento genico. |
Riepilogo – Gene Knockout vs Gene Knockdown
Le due tecniche di cui abbiamo discusso qui; il gene knockout e knockdown, sono metodi per studiare le funzioni di diversi geni. Il knockout del gene rende il gene completamente inoperativo mentre il knockdown del gene silenzia il gene di interesse. Tuttavia, entrambe le procedure impediscono l'espressione genica. Agenti diversi sono in grado di realizzare questi due processi. Il knockout genico è un tipo di eliminazione mentre il knockdown genico è un tipo di inattivazione. Questa è la differenza tra knock out e knockdown del gene.
