La differenza fondamentale tra motivo e dominio è che il motivo non è stabile indipendentemente mentre il dominio è stabile in modo indipendente.
Le proteine sono importanti macromolecole biologiche presenti nel nostro corpo. D' altra parte, il codice genetico di un gene deciderà la sequenza amminoacidica di una proteina. Inoltre, le proteine hanno strutture primarie, secondarie e terziarie. La struttura primaria è la sequenza amminoacidica della catena polipeptidica. Quando le catene polipeptidiche si piegano l'una con l' altra, formano la struttura secondaria della proteina. Alle strutture secondarie appartengono le eliche alfa, i fogli beta e le strutture supersecondarie. Alcuni raggruppamenti di elementi supersecondari sono noti come motivi proteici. La struttura terziaria di una proteina si riferisce alla sua struttura tridimensionale che decide la funzione della proteina. Il dominio è una sezione ripiegata di una molecola proteica, che è globulare e ha una funzione discreta. È la struttura funzionale e tridimensionale fondamentale della proteina.
Cos'è il motivo?
Il motivo è un certo raggruppamento di elementi super secondari di proteine come eliche alfa e strutture beta. Sono una sorta di pattern presenti in diverse proteine. I motivi descrivono i modelli di piegatura degli elementi strutturali secondari e le loro interazioni. Questi modelli di piegatura si stabilizzano da collegamenti simili che sono presenti nelle strutture terziarie. Tuttavia, non sono così complesse come le strutture terziarie.
Figura 01: Motivo
Sono semplici combinazioni di strutture secondarie di proteine. Il motivo non è stabile di per sé. Inoltre, i motivi spiegano la struttura di una proteina ma non predicono la funzione di una proteina. Esempi di motivi proteici sono un motivo beta-alfa-beta, un motivo a chiave greca, un barilotto beta, un motivo a meandro beta, ecc.
Cos'è il dominio?
Il dominio è un'unità fondamentale, funzionale e tridimensionale di una proteina. Svolge una funzione particolare. Una singola proteina può avere diversi domini distinti. Ogni dominio è un'unità indipendente. È una struttura globulare. È responsabile di una specifica funzione o interazione. I domini possono essere utilizzati per ipotizzare la funzione di una proteina non caratterizzata. Quando si analizza una proteina, è essenziale tenerne conto poiché i domini sono le unità funzionali della proteina.
Figura 02: Tre diversi domini di piruvato chinasi
I domini sono strutture molto stabili e compatte. Possono essere facilmente distinti dalle altre regioni. La piruvato chinasi ha tre domini distinti, come mostrato nella figura 02. La lunghezza del dominio può variare e la lunghezza media è di 100 aminoacidi. Ogni dominio contiene un nucleo idrofobico costruito da unità strutturali secondarie. Diversi domini formano collettivamente la struttura terziaria di una proteina.
Quali sono le somiglianze tra motivo e dominio?
- Motivo e dominio sono unità presenti nelle molecole proteiche stesse.
- Sono utili per classificare le famiglie di proteine.
Qual è la differenza tra motivo e dominio?
Il motivo è un certo raggruppamento di elementi super secondari di proteine come eliche alfa e strutture beta mentre il dominio è l'unità funzionale di una proteina. Inoltre, il motivo è una struttura secondaria mentre il dominio è responsabile della struttura terziaria della proteina. Inoltre, il dominio è un'unità indipendente, a differenza di un motivo. Inoltre, il dominio descrive la funzione di una proteina mentre il motivo non lo è. Queste sono le principali differenze tra motivo e dominio. L'infografica di seguito presenta la differenza tra motivo e dominio in forma tabellare.
Riepilogo – Motivo vs Dominio
Il motivo è una disposizione delle strutture secondarie della molecola proteica. Di solito non è stabile di per sé, a differenza di un dominio. Il dominio è una struttura indipendentemente stabile di una proteina. Pertanto, può essere una parte o un'intera molecola proteica. È un'unità funzionale fondamentale tridimensionale della proteina. Inoltre, ha una funzione, ed è un'unità indipendente. Motif può far parte del dominio. Ma il dominio non può essere una parte di un motivo. Questa è la differenza tra motivo e dominio.
