La differenza fondamentale tra sito attivo e sito di legame è che un sito attivo aiuta la catalisi di una reazione chimica mentre un sito di legame aiuta il legame di un ligando a una grande molecola.
Un sito di legame è una regione su una proteina, DNA o RNA, a cui un ligando può legarsi. Gli enzimi sono proteine. Un sito attivo è una regione su un enzima a cui i substrati possono legarsi per subire una reazione chimica. Questa regione specifica ha anche un sito di legame insieme a un sito catalitico. Pertanto, i siti di legame aiutano solo nel legame di un ligando a una grande molecola mentre i siti attivi aiutano sia il legame di un ligando a una grande molecola lasciandolo subire una reazione chimica catalizzata.
Cos'è il sito attivo?
Il sito attivo è una regione su un enzima a cui si legano i substrati di una reazione chimica per subire una reazione chimica catalizzata. questa regione è costituita da due sottoregioni come sito di legame e sito catalitico. Il sito di legame contiene alcuni residui che possono favorire il legame del substrato (reattivi) con l'enzima. Il sito catalitico aiuta a catalizzare la reazione chimica. Inoltre, questa regione è molto piccola rispetto all'intero volume dell'enzima; circa il 10-20% dell'intero volume dell'enzima.
Figura 01: Il sito di legame e il sito catalitico di un sito attivo
Di solito, il sito attivo contiene 3-4 aminoacidi. il resto degli amminoacidi nell'enzima coinvolti nel mantenimento della struttura terziaria dell'enzima. Ancora più importante, un sito attivo ha un design specifico che può adattarsi a un substrato specifico. Pertanto, questi enzimi reagiscono solo con substrati particolari. Ma a volte, gli enzimi hanno bisogno di cofattori per la loro funzione. La funzione principale del sito attivo è ridurre l'energia di attivazione di una reazione chimica, aumentando così la velocità di reazione.
Che cos'è il sito vincolante?
Il sito di legame è una regione su una proteina, DNA o RNA a cui possono legarsi i ligandi. Lì, il ligando può formare un legame chimico con questo sito. Queste regioni mostrano specificità; un particolare ligando si legherà a un particolare sito di legame. Pertanto, questo sito è una misura dei tipi di ligandi che possono legarsi con una molecola.
Inoltre, utilizziamo spesso queste regioni per la caratterizzazione funzionale delle biomolecole. Ad esempio, possiamo caratterizzare la funzionalità di un sito attivo attraverso il suo sito di legame. Inoltre, nel caso del DNA, il tipo specifico di sito di legame è il sito di legame del fattore di trascrizione presente sul DNA.
Qual è la differenza tra sito attivo e sito vincolante?
Il sito attivo è una regione su un enzima a cui si legano i substrati di una reazione chimica per subire una reazione chimica catalizzata mentre il sito di legame è una regione su una proteina, DNA o RNA, a cui possono legarsi i ligandi. Questa è la differenza chiave tra sito attivo e sito di collegamento. Inoltre, i siti attivi sono presenti sugli enzimi e aiutano ad aumentare la velocità di reazione di una particolare reazione chimica diminuendo la barriera energetica di attivazione di quella reazione. I siti di legame, d' altra parte, sono responsabili del legame di un ligando specifico con una particolare molecola.
L'infografica sottostante presenta la differenza tra sito attivo e sito vincolante in forma tabellare.
Riepilogo – Sito attivo e sito vincolante
I siti attivi sono regioni su enzimi che possono aumentare la velocità di reazione di una reazione chimica riducendo la barriera energetica di attivazione di quella reazione. Un sito di legame è qualsiasi regione a cui un ligando può legarsi. Il sito attivo contiene anche un sito di collegamento. La differenza tra sito attivo e siti di collegamento risiede nell'esistenza e nella funzionalità. Pertanto, la differenza chiave tra sito attivo e sito di legame è quella un sito attivo aiuta la catalisi di una reazione chimica mentre un sito di legame aiuta il legame di un ligando a una grande molecola.