La differenza fondamentale tra linker e adattatore è che un linker non ha estremità coese mentre un adattatore ha un'estremità coesa.
La legatura del DNA è il processo di unione di due molecole di DNA, formando legami fosfodiestere. L'enzima chiamato DNA ligasi catalizza questa reazione. È uno dei passaggi critici nei moderni campi della biologia molecolare come la tecnologia del DNA ricombinante e la clonazione del DNA. L'efficienza della legatura dipende dalle estremità delle molecole di DNA da legare. Esistono due tipi di estremità del DNA come estremità appiccicose e estremità smussate. L'efficienza della legatura è elevata con le estremità appiccicose rispetto alle estremità smussate. Se le molecole di DNA bersaglio hanno estremità smussate, saranno utili molecole chiamate adattatori o linker. Adattatori e linker sono molecole oligonucleotidiche sintetizzate chimicamente che aiutano nella legatura del DNA. Hanno anche siti di restrizione interna. L'adattatore ha un'estremità adesiva e un'estremità smussata, mentre il linker ha due estremità smussate.
Cos'è un linker?
Linker è una sequenza oligonucleotidica sintetizzata chimicamente a doppio filamento. Linker ha due estremità smussate. Il linker viene utilizzato per legare le molecole di DNA che hanno estremità smussate ai vettori. Contiene uno o più siti di restrizione interna. Questi siti di restrizione funzionano come siti di riconoscimento degli enzimi di restrizione.
Figura 01: Linker
Dopo la legatura, il DNA viene nuovamente limitato con enzimi di restrizione per produrre estremità coesive. I linker EcoRI e i linker sal-I sono linker comunemente usati.
Cos'è un adattatore?
Un adattatore è una sequenza oligonucleotidica a doppio filamento usata per collegare insieme due molecole di DNA. È una breve sequenza con un'estremità smussata e un'estremità appiccicosa o coesa. Pertanto, è costituito da una coda a filamento singolo a un'estremità, che migliora l'efficienza della legatura del DNA.
Figura 02: Legatura del DNA con un adattatore
Inoltre, l'adattatore ha siti di restrizione interni. Pertanto, dopo la legatura, il DNA può essere limitato con appropriati enzimi di restrizione per creare un nuovo capolinea sporgente. Uno svantaggio degli adattatori è che due adattatori possono formare dimmer accoppiando la base con se stessi. Questo può essere evitato trattandoli con l'enzima chiamato fosfatasi alcalina.
Quali sono le somiglianze tra Linker e Adaptor?
- Sia il linker che l'adattatore sono sequenze oligonucleotidiche corte a doppio filamento.
- Trasmettono siti di restrizione interna.
- Inoltre, sono molecole di DNA sintetizzate chimicamente e sono molecole sintetiche.
- Possono collegare due molecole di DNA insieme.
- Dopo la legatura di linker e adattatori, il DNA viene nuovamente limitato con enzimi di restrizione per produrre estremità appiccicose.
Qual è la differenza tra linker e adattatore?
Un linker è un breve duplex oligonucleotidico sintetizzato chimicamente con due estremità smussate. Un adattatore è un breve duplex oligonucleotidico sintetizzato chimicamente con un'estremità appiccicosa e un'estremità smussata. Pertanto, questa è la differenza chiave tra linker e adattatore. Inoltre, gli adattatori possono formare dimeri, mentre i linker non formano dimeri. Quindi, questa è un' altra differenza significativa tra linker e adattatore.
Di seguito è riportato un riepilogo delle differenze tra linker e adattatore in forma tabellare.
Riepilogo – Linker vs adattatore
Linker e adattatore sono due tipi di oligonucleotidi sintetizzati chimicamente che sono utili nella legatura del DNA a punta smussata. Il linker ha due estremità smussate, mentre l'adattatore ha un'estremità smussata e un'estremità coesa. Quindi, questa è la differenza chiave tra linker e adattatore. Sono molecole a doppio filamento che hanno siti di restrizione interna. Sono ampiamente utilizzati nella tecnologia del DNA ricombinante e nella clonazione del DNA.
