La differenza chiave tra Shine Dalgarno e la sequenza Kozak è che la sequenza Shine Dalgarno è un sito di legame ribosomiale nell'RNA messaggero batterico e arcaico, mentre la sequenza Kozak è un sito di inizio della traduzione proteica nella maggior parte degli RNA messaggeri eucariotici.
Shine La sequenza di Dalgarno e Kozak sono due sequenze di consenso molto importanti per l'inizio della traduzione. In biologia molecolare, la traduzione è il processo mediante il quale i ribosomi nel citoplasma sintetizzano le proteine dopo il processo di trascrizione. Nella traduzione, un mRNA (RNA messaggero) viene decodificato in un ribosoma per produrre una specifica catena di amminoacidi all'esterno del nucleo. Tipicamente, un ribosoma induce il processo di decodifica facilitando il legame di sequenze di anticodoni tRNA complementari ai codoni di mRNA. La traduzione procede in tre fasi: inizio, allungamento e terminazione.
Cos'è la sequenza di Shine Dalgarno?
Shine La sequenza di Dalgarno è un sito di legame ribosomiale nell'RNA messaggero batterico e arcaico. Si trova generalmente intorno a 8 basi a monte del codone di partenza AUG. Questa sequenza di RNA aiuta a reclutare i ribosomi nell'RNA messaggero allineando il ribosoma con un codone di inizio dell'mRNA. Pertanto, avvia la sintesi proteica. Una volta dopo il reclutamento, il tRNA può aggiungere amminoacidi in sequenza come dettato dai codoni dell'mRNA. Questa sequenza speciale è comune nei batteri ma più rara negli archaea. Inoltre, è presente anche nei cloroplasti e nei trascritti mitocondriali. La sequenza di Shine Dalgarno è stata proposta per la prima volta dagli scienziati australiani John Shine e Lynn Dalgarno. La sequenza di consenso di sei basi è AGGAGG. Ad esempio, in Escherichia coli la sequenza è AGGAGGU.
Figura 01: Sequenza di Shine Dalgarno
La selezione del sito di iniziazione (AUG) dipende dall'interazione tra la subunità 30S del ribosoma e il modello di mRNA. La regione ricca di pirimidina sul componente 16srRNA della subunità 30S si lega alla regione ricca di purine nota come sequenza Shine Dalgarno a monte del codone di inizio AUG nell'mRNA. Inoltre, durante la formazione del complesso di iniziazione, queste sequenze nucleotidiche complementari si accoppiano per formare una struttura di RNA a doppio filamento. Ciò facilita il legame dell'mRNA a un ribosoma in modo tale che il codone di inizio sia posizionato nel sito P del ribosoma.
Cos'è la sequenza di Kozak?
La sequenza di Kozak è un sito di inizio della traduzione proteica nella maggior parte degli mRNA eucariotici. Questa sequenza è anche chiamata sequenza di consenso di Kozak. La sequenza di Kozak è la sequenza ottimale per avviare la traduzione negli eucarioti. Questa sequenza è un aspetto integrale della regolazione delle proteine. È anche molto importante per la salute cellulare generale. Aiuta a correggere la traduzione delle proteine dai messaggi genetici mediando l'assemblaggio del ribosoma e l'inizio della traduzione.
Figura 02: Sequenza di Kozak
Questa sequenza prende il nome dalla scienziata che l'ha scoperta, Marilyn Kozak. Lo ha scoperto attraverso un'analisi dettagliata delle sequenze genomiche del DNA. La sequenza di Kozak è 5' (gcc) gccRccAUGG-3'. Le lettere maiuscole indicano basi conservate, mentre le lettere minuscole indicano basi variabili comuni. R indica una purina (adenina o guanina) che è sempre posizionata in questa posizione.
Quali sono le somiglianze tra Shine Dalgarno e la sequenza di Kozak?
- La sequenza Shine Dalgarno e Kozak sono due sequenze di consenso molto importanti nell'inizio della traduzione.
- Entrambe sono sequenze di RNA.
- La subunità più piccola del ribosoma si lega ad entrambe le sequenze.
- Entrambe le sequenze mediano il corretto assemblaggio del ribosoma e l'inizio della traduzione.
- Sono aspetti integrali della regolazione delle proteine e della salute cellulare generale.
Qual è la differenza tra Shine Dalgarno e la sequenza di Kozak?
Shine La sequenza di Dalgarno è un sito di legame ribosomiale che si trova nell'RNA messaggero batterico e arcaico, mentre la sequenza di Kozak è un sito di inizio della traduzione proteica che si trova nella maggior parte degli RNA messaggeri eucariotici. Quindi, questa è la differenza chiave tra la sequenza di Shine Dalgarno e Kozak. Inoltre, la sequenza di Shine Dalgarno è 5'AGGAGGU3' mentre, la sequenza di Kozak è 5' (gcc) gccRccAUGG-3'.
La seguente infografica elenca le differenze tra Shine Dalgarno e la sequenza di Kozak in forma tabellare per un confronto fianco a fianco.
Riepilogo – Sequenza Shine Dalgarno vs Kozak
Le sequenze Shine Dalgarno e Kozak sono due sequenze di RNA di consenso che sono molto importanti per l'assemblaggio del ribosoma e l'inizio della traduzione. La sequenza Shine Dalgarno è un sito di legame ribosomiale nell'RNA messaggero batterico e arcaico, mentre la sequenza di Kozak è un sito di inizio della traduzione proteica nella maggior parte degli RNA messaggeri eucariotici. Quindi, questo riassume la differenza tra Shine Dalgarno e la sequenza di Kozak.
