La differenza fondamentale tra SF1 e SF2 è la loro capacità di svolgere gli acidi nucleici. Mentre SF1 svolge solo DNA, SF2 svolge sia DNA che RNA.
Helicase è uno degli enzimi chiave che prendono parte al processo di replicazione del DNA e ai processi di riparazione del DNA. Il ruolo principale dell'elicasi è quello di prendere parte al processo di svolgimento per facilitare la separazione delle molecole di DNA a doppio filamento. L'attività dell'enzima è essenziale durante la fase di inizio della replicazione del DNA. Le eliche sono divise in Super Famiglia 1 e Super Famiglia 2 principalmente in base alle loro differenze strutturali. All'interno di ogni Super Famiglia, ci sono più diversi tipi di elica.
Cos'è SF1?
L'elicasi della Super Famiglia 1 è un tipo di elicasi che comprende una struttura esamerica insieme alla proteina centrale interna, che descrive l'attività dell'elicasi. L'elicasi SF1 è una delle più grandi classi di elicasi e può essere ulteriormente classificata come elicasi SF1A e elicasi SF1B. Proteine come PcrA, Rep e UvrD, appartengono alla classe delle elicasi SF1A. In confronto, proteine come RecA e Dda appartengono alla classe delle elicasi SF1B. Le funzioni delle eliche SF1 variano ampiamente. Alcune delle funzioni vitali delle elicasi SF1 includono la replicazione del DNA, la ricombinazione del DNA, l'elaborazione dei frammenti di Okazaki, la formazione di telomeri e la riparazione dell'escissione di nucleotidi del danno al DNA. In alcune specie batteriche, anche il tipo SF1 di elicasi contribuisce al trasferimento genico orizzontale tramite la coniugazione. Inoltre, nei virus, le elicasi SF1 aiutano nella replicazione virale.
Figura 01: Azione Helicase
Ci sono molti motivi diversi associati alla struttura delle eliche SF1. Contengono almeno 7 motivi conservati tra tutti i diversi tipi di elicasi SF1 (Q, I, Ia, II, III, IV, V e VI). La struttura dell'elicasi SF1 è un cristallo, dove i motivi sono raggruppati insieme. C'è una caratteristica tasca di legame dell'ATP tra i motivi e il sito di legame del DNA. I domini non conservati sono distribuiti per mantenere l'integrità strutturale della molecola dell'elicasi. Questi domini possono variare tra le elicasi SF1A e le elicasi SF1B.
Cos'è SF2?
Super family 2 helicase è uno dei gruppi più diversi di superfamiglie di helicase. Esistono molti tipi di elicasi SF2 come elicasi tipo RecQ, elicasi tipo RecG, elicasi Rad3/XPD e NS3. Anche alcuni enzimi di restrizione, come gli enzimi di restrizione di tipo I, rientrano in questa categoria. La funzione generale delle elicasi SF2 è lo svolgimento del DNA a doppio filamento. Tuttavia, alcuni tipi di elicasi SF2 non hanno la capacità di agire completamente come enzimi elicasi. Anche le elicasi SF2 sono ampiamente utilizzate nell'elaborazione dell'RNA. La famiglia DEAD-box di elicasi SF2 prende parte all'elaborazione dell'RNA, inclusa la trascrizione, lo splicing, l'elaborazione della traduzione e l'assemblaggio del complesso RNA-proteina.
Figura 02: Elica
La struttura dell'elicasi SF2 contiene anche motivi conservati. Tuttavia, alcuni domini differiscono leggermente da quello dell'elicasi SF1. Contengono anche un dominio di legame dell'ATP oltre al dominio di legame del DNA.
Quali sono le somiglianze tra SF1 e SF2?
- SF1 e SF2 mostrano attività dell'elica.
- Inoltre, entrambi prendono parte alla replicazione e alla ricombinazione del DNA.
- SF1 e SF2 sono composti da motivi conservati.
- Entrambi hanno un dominio di legame dell'ATP e un dominio di legame del DNA.
- Queste forme sono proteine multidominio.
- Inoltre, se si verificano mutazioni in uno dei due tipi, si verificheranno effetti deleteri.
- Sia SF1 che SF2 sono fondamentali per garantire la continuità del ciclo cellulare.
- SF1 e SF2 si trovano sia nei procarioti che negli eucarioti.
Qual è la differenza tra SF1 e SF2?
SF1 e SF2 sono due super famiglie di elicasi. Mostrano un'ampia diversità. Il differenza fondamentale tra SF1 e SF2 è quello SF1 è principalmente coinvolto nello svolgimento del DNA, mentre SF2 partecipa anche all'elaborazione dell'RNA durante la trascrizione e la traduzione. Quando si confrontano i diversi motivi della proteina, SF1 e SF2 differiscono principalmente in base al motivo III e al motivo IV. Anche se hanno una somiglianza strutturale, le elicasi SF1 formano strutture toroidali esamerica mentre SF2 non forma queste disposizioni strutturali.
Un' altra differenza tra SF1 e SF2 è che le elicasi SF1 preferiscono maggiormente i nucleotidi di adenina, mentre le elicasi SF2 preferiscono tutti e cinque i nucleotidi come bersaglio per lo svolgimento. Quando si confronta la direzione di svolgimento, le elicasi SF1 si traslocano solo nella direzione da 5' a 3', mentre le elicasi SF2 hanno la capacità di traslocare insieme agli acidi nucleici in entrambe le direzioni.
L'infografica qui sotto presenta le differenze tra SF1 e SF2 in forma tabellare per un confronto affiancato.
Riepilogo – SF1 vs SF2
Le eliche sono un gruppo molto importante e diversificato di enzimi che prendono parte alla replicazione del DNA. Tuttavia, a causa della sua elevata diversità, gli enzimi sono classificati in superfamiglie. SF1 e SF2 sono le due più grandi super famiglie di eliche. Mentre SF1 è principalmente associato all'elaborazione correlata al DNA, SF2 è associato sia all'elaborazione del DNA che dell'RNA. Pertanto, questa è la differenza chiave tra SF1 e SF2. Inoltre, SF1 e SF2 differiscono anche nella loro disposizione strutturale poiché SF2 non forma strutture esamerica. Le mutazioni nelle elicasi SF1 e SF2 porteranno allo sviluppo del cancro in seguito alla disregolazione del ciclo cellulare e ad altri meccanismi vitali come la riparazione del DNA.
