La differenza fondamentale tra gli enzimi di restrizione EcoRI e HindIII è che EcoRI è un enzima di restrizione di tipo II isolato da E. coli, mentre HindIII è un enzima di restrizione di tipo II isolato dall'influenza Haemophilus.
L'enzima di restrizione o endonucleasi di restrizione è un enzima che scinde il DNA in frammenti in siti di riconoscimento specifici (siti di restrizione) all'interno della molecola di DNA. Questi enzimi di restrizione si trovano nei batteri e negli archaea. Forniscono un meccanismo di difesa contro i virus invasori. Gli enzimi di restrizione sono generalmente classificati in cinque diversi tipi: tipo I, tipo II, tipo III, IV e tipo V. EcoRI e HindIII sono due enzimi di restrizione che appartengono al gruppo degli enzimi di restrizione di tipo II.
Cosa sono gli enzimi di restrizione EcoRI?
EcoRI è un enzima di restrizione di tipo II isolato dalle specie di E.coli. È un enzima di restrizione che scinde le doppie eliche del DNA in frammenti in siti specifici. EcoRI fa anche parte del sistema di modifica delle restrizioni. EcoRI è stato il primo enzima originariamente isolato dal ceppo RY13 della specie E. coli. È usato come enzima di restrizione in biologia molecolare. EcoRI crea 4 estremità adesive nucleotidiche con sporgenze di 5' di AATT. EcoRI taglia il DNA alla sequenza di riconoscimento specifica G↓AATTC. Ha la sequenza complementare palindromica di CTTAA↓G. Inoltre, questo enzima di restrizione appartiene alla sottoclasse di tipo II P (specificità palindromica). Nella sua struttura primaria, EcoRI contiene il motivo PD. D/EXK all'interno del suo sito attivo, come molti altri enzimi di restrizione.
Figura 01: EcoRI
L'enzima di restrizione EcoRI è un omodimero di 31 kDa. Contiene un dominio globulare dell'architettura α/β. Ogni subunità contiene un anello che sporge dal dominio globulare e avvolge il DNA quando è legato. Questo enzima può essere cocristallizzato con la sequenza che normalmente taglia. Inoltre, l'enzima di restrizione EcoRI viene utilizzato in un'ampia varietà di tecniche di genetica molecolare, tra cui clonazione, screening del DNA e sezioni di eliminazione di condizioni in vitro del DNA.
Cosa sono gli enzimi di restrizione HindIII?
HindIII è un enzima di restrizione di tipo II isolato dalle specie di influenza Haemophilus. Scinde la sequenza palindromica del DNA AACCTT in presenza del cofattore Mg2+ mediante idrolisi. La scissione di questa particolare sequenza tra gli AA'S (5'A↓ACCTT3' e 3'TTCGA↓A5') si traduce in sporgenze di 5' sulla molecola di DNA chiamate estremità adesive. Questo enzima si trova negli organismi procarioti come i batteri. I batteri utilizzano questo enzima come meccanismo di difesa contro virus come i batteriofagi.
Figura 02: HindIII
Strutturalmente, HindIII è un omodimero. Contiene un nucleo strutturale comune comprendente quattro fogli β e una singola α eliche, come altri tipi di enzimi di restrizione II. La massa molecolare di questo enzima è 34,9 kDa. Inoltre, HindIII è molto utile nei moderni esperimenti di scienze biologiche molecolari come il sequenziamento e la mappatura del DNA.
Quali sono le somiglianze tra gli enzimi di restrizione EcoRI e HindIII?
- EcoRI e HindIII sono due enzimi di restrizione appartenenti al gruppo degli enzimi di restrizione di tipo II.
- EcoRI e HindIII sono stati trovati all'inizio degli anni '70.
- EcoRI e HindIII contengono entrambi il motivo della sequenza di amminoacidi PD.. D/EXK.
- Entrambi gli enzimi di restrizione eseguono una scissione molto specifica del DNA.
- Questi enzimi di restrizione necessitano di Mg2+ come cofattore per la loro attività specifica.
- Producono punte appiccicose dopo aver tagliato il DNA.
- Sono componenti molto utili nella moderna ricerca biologica molecolare.
Qual è la differenza tra gli enzimi di restrizione EcoRI e HindIII?
EcoRI è un enzima di restrizione di tipo II isolato dalle specie di E.coli, mentre HindIII è un enzima di restrizione di tipo II isolato dalle specie di Haemophilus influenza. Quindi, questa è la differenza chiave tra EcoRI e HindIII. Inoltre, EcoRI taglia il DNA alla sequenza di riconoscimento specifica G↓AATTC, mentre HindIII taglia il DNA alla sequenza di riconoscimento specifica A↓ACCTT.
L'infografica qui sotto presenta le differenze tra EcoRI e HindIII in forma tabellare per un confronto affiancato.
Riepilogo – Enzimi di restrizione EcoRI vs HindIII
EcoRI e HindIII sono due enzimi di restrizione che appartengono alla sottoclasse p di tipo II. Eseguono una scissione molto specifica del DNA. EcoRI è un enzima di restrizione di tipo II isolato dalle specie di E.coli, mentre HindIII è un enzima di restrizione di tipo II isolato dalle specie di Haemophilus influenza. Quindi, questo riassume la differenza tra EcoRI e HindIII.
