La differenza chiave tra guanidina tiocianato e guanidina cloridrato è che il guanidina tiocianato è un denaturante proteico più forte che è più comunemente usato nell'isolamento dell'RNA, mentre la guanidina cloridrato è un denaturante proteico più debole che è meno comunemente usato nell'isolamento dell'RNA.
La denaturazione è il processo in cui le proteine perdono la loro struttura quaternaria, terziaria e secondaria che è normalmente presente nel loro stato nativo. Può essere ottenuto mediante l'applicazione di alcuni stress esterni o composti come un acido o una base forte, un sale inorganico concentrato, un solvente organico (alcol, cloroformio), agitazione, irraggiamento o calore. Il tiocianato di guanidina e il cloridrato di guanidina sono due diversi tipi di denaturanti proteici.
Cos'è il tiocianato di guanidina?
Il tiocianato di guanidina (GTC) è un agente denaturante proteico più forte che è più comunemente usato nell'isolamento dell'RNA. È anche noto come isotiocianato di guanidinio (GITC). Essendo un agente caotropico, è un composto chimico usato abitualmente come denaturante proteico generale. Un agente caotropico è una molecola in una soluzione acquosa che può interrompere la rete di legami idrogeno tra le molecole d'acqua. Ciò ha un effetto sulla stabilità dello stato nativo di altre molecole nella soluzione, come macromolecole come proteine e acidi nucleici, indebolendo l'effetto idrofobico. Gli agenti caotropici come il tiocianato di guanidina riducono la quantità di ordine nella struttura delle proteine formate dalle molecole d'acqua sia in massa che nei gusci di idratazione attorno agli amminoacidi idrofobici. Ciò può causare la denaturazione delle proteine.
Il tiocianato di guanidina può essere utilizzato per disattivare virus come l'influenza che causano malattie come l'influenza spagnola nel 1918. Pertanto, può essere utilizzato in configurazioni mediche o ospedaliere. Inoltre, il tiocianato di guanidina viene utilizzato anche per lisare cellule e particelle virali nelle estrazioni di RNA e DNA. Qui, la funzione del tiocianato di guanidina è di favorire l'azione di lisi e di prevenire l'attività degli enzimi RNasi e degli enzimi DNasi mediante denaturazione. Questi enzimi danneggerebbero altrimenti l'estratto (RNA o DNA).
Cos'è la guanidina cloridrato?
Guanidina cloridrato (GdnHCl) è un denaturante proteico più debole che è meno comunemente usato nell'isolamento dell'RNA. È anche noto come cloruro di guanidinio (GdmCl). È il sale cloridrato della guanidina. La guanidina cloridrato è caotropica e uno dei denaturanti utilizzati negli studi fisico-chimici sul ripiegamento delle proteine.
Figura 01: Guanidina cloridrato
Guanidina cloridrato ha anche la capacità di diminuire l'attività enzimatica e aumentare la solubilità delle molecole idrofobiche. Normalmente, a concentrazioni più elevate di guanidina cloridrato, le proteine perdono la loro struttura ordinata. Le proteine tendono ad avvolgersi in modo casuale a questa concentrazione di guanidina cloridrato. In ambito medico o ospedaliero, la guanidina cloridrato è indicata per la riduzione dei sintomi di debolezza muscolare e di facile affaticabilità associati alla malattia della sindrome di Eaton-Lambert. Inoltre, gli effetti collaterali dell'uso di guanidina cloridrato possono includere peristalsi, diarrea e soppressione del midollo osseo fatale.
Quali sono le somiglianze tra guanidina tiocianato e guanidina cloridrato?
- Guanidina tiocianato e guanidina cloridrato sono due diversi tipi di denaturanti proteici.
- Entrambi i denaturanti hanno guanidina nelle loro strutture.
- Sono agenti caotropici.
- Entrambi i denaturanti possono essere utilizzati per l'isolamento dell'RNA.
- Sono entrambi utilizzati in strutture mediche o ospedaliere.
Qual è la differenza tra guanidina tiocianato e guanidina cloridrato?
Il tiocianato di guanidina è un denaturante proteico più forte che è più comunemente usato nell'isolamento dell'RNA, mentre la guanidina cloridrato è un denaturante proteico più debole che è meno comunemente usato nell'isolamento dell'RNA. Pertanto, questa è la differenza chiave tra guanidina tiocianato e guanidina cloridrato. Inoltre, la formula chimica del tiocianato di guanidina è C2H6N4S, mentre la formula chimica di guanidina cloridrato è CH5N3HCl.
L'infografica qui sotto presenta le differenze tra guanidina tiocianato e guanidina cloridrato in forma tabellare per un confronto fianco a fianco.
Riepilogo – Guanidina tiocianato vs guanidina cloridrato
Guanidina tiocianato e guanidina cloridrato sono due diversi tipi di denaturanti proteici. Entrambi i denaturanti sono caotropi. Il tiocianato di guanidina è un denaturante proteico più forte che è più comunemente usato nell'isolamento dell'RNA, mentre la guanidina cloridrato è un denaturante proteico più debole che è meno comunemente usato nell'isolamento dell'RNA. Quindi, questo riassume la differenza tra guanidina tiocianato e guanidina cloridrato.
