siRNA vs miRNA
Gli RNA sono molecole molto importanti, che aiutano a costruire la vita degli organismi. Recentemente gli scienziati hanno scoperto piccoli RNA chiamati RNA interference o RNAi, che agiscono dopo la trascrizione per controllare l'espressione genica. I due principali tipi di piccoli RNA sono micro RNA o miRNA e piccoli RNA interferenti o siRNA. Queste molecole regolano sostanzialmente l'espressione genica sopprimendo il gene bersaglio. Sia il miRNA che il siRNA hanno percorsi di biogenesi molto simili, sebbene esistano alcune differenze tra di loro. L'origine di miRNA e siRNA proviene da molecole di dsRNA. I miRNA maturi sono strutturalmente simili alle molecole di siRNA.
miRNA
I micro RNA o miRNA sono le piccole molecole di RNA che mediano il controllo finale nella regolazione genica traslazionale. La deregolamentazione del miRNA può portare al cancro e allo sviluppo di altre malattie. Pertanto, la corretta regolazione delle informazioni codificate nella regione non codificante del miRNA è molto critica in molti processi cellulari fondamentali.
siRNA
Gli siRNA sono anche indicati come RNA di interferenza o silenziamento corto e sono costituiti da RNA a doppio filamento con da 20 a 25 coppie di basi. Il ruolo principale del siRNA è quello di interferire con l'espressione di geni specifici con sequenze nucleotidiche complementari. siRNA è costituito da RNA corto a doppio filamento con estremità 5' fosforilate e estremità 3' idrossilate con due nucleotidi sovrastanti.
Qual è la differenza tra siRNA e miRNA?
• miRNA derivato da specifici loci genomici, mentre siRNA derivato da mRNA, trasposoni, virus o DNA eterocromatico.
• La sintesi di miRNA viene elaborata da trascrizioni a forcina precursore più lunghe (sequenza di miRNA nucleare primario da parte dell'endonucleasi RNasi III), mentre quella di siRNA elaborata da lunghi duplex di RNA bimolecolari.
• Ciascuna molecola di precursore della forcina di miRNA produce un singolo duplex di miRNA, mentre ogni molecola di precursore di siRNA produce più duplex di siRNA.
• Le sequenze di siRNA sono raramente conservate, mentre le sequenze di miRNA sono ben conservate.
• Tutte le basi all'interno di siRNA contribuiscono alla sua specificità target, mentre solo 5' metà del miRNA contribuisce alla sua specificità target.
• i miRNA spesso si legano alla regione 3' non tradotta dei trascritti target, mentre i siRNA formano duplex complementare ovunque lungo un mRNA target.
• miRNA specifica 'etero-silenziamento' mentre siRNA utilizzato per 'silenziamento automatico'.
• miRNA funge da segnale per impedire la traduzione, mentre siRNA impedisce fisicamente la traduzione.