La differenza chiave tra sintenia e collinearità è che la sintenia è la co-localizzazione fisica di loci genetici sullo stesso cromosoma in specie, mentre la collinearità è la co-localizzazione fisica di loci genetici sullo stesso cromosoma in specie diverse che conservano lo stesso ordine.
Sintenia e collinearità sono due termini usati in modo intercambiabile in genomica. Entrambi i termini descrivono i modelli di localizzazione genica sui cromosomi in diverse specie. Questi accordi genetici correlati tra i taxa sono informazioni preziose quando si deduce l'ascendenza condivisa dei geni. Synteny si riferisce alla co-localizzazione fisica di loci genetici sullo stesso cromosoma in specie. La collinearità si riferisce alla co-localizzazione fisica di loci genetici sullo stesso cromosoma in specie diverse che conservano lo stesso ordine. Pertanto, è una forma di sintenia.
Cos'è Synteny?
In specie diverse, c'è un insieme di geni situati sullo stesso cromosoma. E questa co-localizzazione fisica di geni sullo stesso cromosoma in specie diverse è nota come sintenia. Inoltre, questi geni si trovano molto vicini tra loro su un singolo cromosoma. L'ordine dei geni potrebbe non essere necessariamente lo stesso. Ma la localizzazione dei geni vicini l'uno all' altro sullo stesso cromosoma avviene in sintenia. Pertanto, la sintenia descrive principalmente il modello di distribuzione dei geni su un cromosoma. Questi modelli di co-localizzazione genica indicano relazioni tra specie diverse e la loro evoluzione. Tuttavia, la sintesi può essere interrotta a causa di riarrangiamenti cromosomici come traslocazioni, inversione e fusione cromosomica, ecc. duplicazioni, perdita e ricombinazione omologa ineguale.
Figura 01: Sintesi
Si ritiene che tutti i geni collegati siano sintenici. Tuttavia, non tutti i geni sintetici sono necessariamente collegati. Possiedono sequenze cromosomiche comuni. Gli esseri umani hanno molti geni sintetici con altri mammiferi. Inoltre, molti cereali hanno geni sintetici.
Cos'è la collinearità?
Collinearità è una forma più specifica di sintenia in cui un insieme di geni si trova sullo stesso cromosoma di specie diverse nello stesso ordine delle specie ancestrali. Pertanto, se c'è una deviazione dalla collinearità, sarà un carattere filogenetico più affidabile poiché la collinearità spiega l'ascendenza condivisa dei geni.
Figura 02: Collinearità
L'analisi della collinearità a più vie fornisce informazioni molto più affidabili sulle specie correlate e sulla loro filogenesi.
Quali sono le somiglianze tra sintenia e collinearità?
- Sia in sintenia che in collinearità, un insieme di loci in due specie diverse si trova sullo stesso cromosoma.
- Questi termini descrivono la co-localizzazione fisica di loci genetici sullo stesso cromosoma.
- Collinearità è una forma più specifica di sintenia.
- A volte entrambi i termini sono usati in modo intercambiabile in genomica.
- Se due regioni hanno collinearità, sono ovviamente sinteniche.
- Sono utili per inferire la filogenesi.
Qual è la differenza tra sintenia e collinearità?
Sintenia e collinearità sono due termini usati in modo intercambiabile in genomica. Synteny si riferisce alla co-localizzazione fisica di un insieme di geni nello stesso cromosoma in specie diverse. La collinearità è una forma di sintenia in cui l'insieme dei geni è co-localizzato nello stesso ordine tra le diverse specie. Pertanto, questa è la differenza chiave tra sintenia e collinearità.
Riepilogo – Sintesi vs Collinearità
I termini sintenia e collinearità si riferiscono a un insieme di geni che si trovano sullo stesso cromosoma in specie diverse. In effetti, questi geni sono co-localizzati nello stesso cromosoma in specie diverse. La sintenia descrive la co-localizzazione fisica di geni insiemi sullo stesso cromosoma in specie diverse, mentre la collinearità è una forma più specifica di sintenia in cui l'insieme di geni è co-localizzato nello stesso ordine. Pertanto, questo riassume la differenza tra sintenia e collinearità.
