La differenza fondamentale tra l'estrazione del DNA vegetale e quella animale è che nell'estrazione del DNA vegetale, è necessario rompere la parete cellulare macinando il tessuto in ghiaccio secco o azoto liquido per rilasciare il contenuto cellulare durante l'estrazione del DNA animale, non è necessario eseguire questo passaggio poiché le cellule animali non hanno una parete cellulare.
Il DNA genomico è il materiale genetico delle cellule vegetali e animali. Il DNA genomico è unico per ogni singola pianta o animale. L'estrazione del DNA di DNA di buona qualità è il prerequisito per la ricerca molecolare. Il DNA degli organismi viene estratto per l'identificazione, la diagnosi di malattie, il rilevamento di geni e sequenze specifici, scopi forensi, test di paternità, sequenziamento del genoma e sviluppo di farmaci, ecc. Il metodo di estrazione del DNA varia a seconda del tipo di cellule, sia che si tratti di una cellula animale o di una cellula vegetale.
Cos'è l'estrazione del DNA vegetale?
Il DNA nelle cellule vegetali viene estratto per vari studi molecolari. È necessario per estrarre il DNA genomico puro e intatto. Quindi, ci sono diversi tipi di protocolli di estrazione del DNA che sono diversi dai protocolli di estrazione del DNA dalle cellule animali. Questo perché le cellule vegetali hanno una parete cellulare che dovrebbe essere rotta per eliminare il contenuto cellulare.
L'estrazione viene solitamente eseguita macinando i tessuti vegetali in ghiaccio secco o azoto liquido usando un mortaio e un pestello. Quindi le membrane cellulari vengono interrotte e il contenuto cellulare viene estratto in un tampone di estrazione. Questo di solito viene fatto usando un detersivo; Tampone SDS (sodio dodecil solfato) o CTAB (cetiltrimetilammonio bromuro). Il DNA rilasciato è protetto dalle nucleasi endogene utilizzando un agente chelante come l'EDTA. Inoltre, le proteine vengono separate dal DNA usando cloroformio o fenolo.
Figura 01: Estrazione del DNA vegetale
Le piante sintetizzano polisaccaridi e polifenoli, inclusi flavonoidi e altri metaboliti secondari. Questi composti interferiscono con l'estrazione del DNA genomico puro. Quindi, la maggior parte dei protocolli di estrazione del DNA vegetale comporta un altro passaggio, come la tecnica del gradiente di densità del cloruro di cesio per eliminare questi composti.
La maggior parte dei protocolli di estrazione del DNA consiglia di utilizzare campioni di foglie fresche per l'estrazione del DNA. Alcuni metodi non includono sostanze chimiche pericolose come l'azoto liquido e il fenolo. Il protocollo CTAB (Cetyl trimethylammonium bromuro) è un popolare protocollo di estrazione del DNA vegetale che facilita l'estrazione di DNA genomico vegetale di alta qualità. È un metodo semplice, sicuro, affidabile ed economico per l'estrazione del DNA delle piante. La maggior parte degli altri metodi sono versioni modificate del metodo CTAB.
Cos'è l'estrazione del DNA animale?
L'estrazione del DNA animale è l'estrazione del DNA genomico da cellule animali per l'analisi molecolare. A differenza dell'estrazione del DNA vegetale, la rottura della parete cellulare non è necessaria per le cellule animali poiché mancano di una parete cellulare. Le cellule del sangue sono il tipo più comune di cellule animali utilizzate per vari scopi.
Figura 02: Estrazione del DNA
Il metodo fenolo-cloroformio è una delle scelte migliori per le cellule del sangue. La resa e la qualità del DNA sono elevate quando si estrae il DNA da questo metodo. È un protocollo di estrazione del DNA liquido-liquido e questo metodo separa le molecole di DNA sulla base della loro solubilità in soluzioni immiscibili. Fenolo, cloroformio e alcol isoamilico sono i tre ingredienti principali di questo metodo.
Quali sono le somiglianze tra l'estrazione del DNA vegetale e animale?
- Durante l'estrazione del DNA sia vegetale che animale, le membrane cellulari devono essere interrotte.
- Il DNA dovrebbe essere protetto dalle nucleasi endogene.
- Inoltre, dovrebbe essere impedito il taglio del DNA.
- Sono disponibili kit commerciali per l'estrazione del DNA vegetale e animale.
- La maggior parte dei metodi di estrazione del DNA vegetale e animale necessita di continue modifiche e standardizzazioni.
Qual è la differenza tra l'estrazione del DNA vegetale e animale?
La differenza fondamentale tra l'estrazione del DNA vegetale e quella animale è che l'estrazione del DNA vegetale richiede la macinazione del tessuto vegetale in ghiaccio secco o azoto liquido per rompere la parete cellulare mentre l'estrazione del DNA animale non richiede questo passaggio poiché sono animali le cellule non hanno una parete cellulare. Il metodo CTAB è uno dei migliori metodi per l'estrazione del DNA vegetale, mentre il metodo fenolo-cloroformio è uno dei migliori metodi per l'estrazione del DNA animale.
Di seguito l'infografica elenca le differenze tra l'estrazione del DNA di piante e animali.
Riepilogo – Estrazione del DNA da piante e animali
Sono disponibili diversi metodi per l'estrazione del DNA da diversi tipi cellulari. Pertanto, i protocolli di estrazione del DNA vegetale differiscono dai protocolli di estrazione del DNA di cellule animali. L'estrazione del DNA vegetale richiede la rottura della parete cellulare, della membrana cellulare e della membrana nucleare mentre l'estrazione del DNA animale richiede la rottura della membrana cellulare e della membrana nucleare. Ancora più importante, l'estrazione del DNA delle cellule animali non richiede l'interruzione delle pareti cellulari mediante macinazione in ghiaccio secco o azoto liquido. Quindi, questa è la differenza chiave tra l'estrazione del DNA vegetale e animale.
