La differenza fondamentale tra ficocianina e alloficocianina è che la ficocianina assorbe ed emette a lunghezze d'onda inferiori rispetto all'alloficocianina.
Le ficobiliproteine sono una famiglia di proteine idrosolubili presenti nei cianobatteri e in alcune specie di alghe. La ficocianina e l'alloficocianina sono due membri principali di questa famiglia.
Cos'è la ficocianina?
La ficocianina è un complesso proteico-pigmento della famiglia delle ficobiliproteine che raccolgono la luce. Altri membri importanti di questa famiglia includono alloficocianina e ficoeritrina. Questo pigmento è un pigmento accessorio della clorofilla. In generale, tutte le ficobiliproteine sono complessi idrosolubili che non possono esistere all'interno delle membrane come i carotenoidi. Invece di esistere nelle membrane, questi pigmenti tendono ad aggregarsi, formando grappoli che possono aderire alle membrane note come ficobilisomi.
Figura 01: Pigmenti di ficocianina estratti (da cianobatteri)
Possiamo osservare che la ficocianina ha un caratteristico colore azzurro che può assorbire luce arancione e rossa (vicino a 620 nm) e può emettere fluorescenza (circa 650 nm). Possiamo trovare questo pigmento di colore nei cianobatteri e il nome "Phycocyanin" deriva dal significato greco di "Phyco" che si riferisce ad "alghe" e il suffisso "cyanin" dal significato greco di "Kyanos" che si riferisce a "blu scuro".
Tipicamente, le molecole di ficocianina condividono una struttura comune con tutte le ficobiliproteine. Quando si considera la struttura di questo pigmento, si inizia con l'assemblaggio dei monomeri ficobiliproteici. Questi monomeri sono eterodimeri costituiti da subunità alfa e beta con i rispettivi cromofori. I cromofori e le subunità sono uniti tra loro tramite un legame chimico tioetere.
Le subunità della struttura della ficocianina contengono tipicamente otto alfa-eliche. Le strutture monomeriche tendono ad aggregarsi spontaneamente, formando trimeri a forma di anello con simmetria rotazionale e un canale centrale. Inoltre, i trimeri tendono ad aggregarsi a coppie, formando esameri che sono assistiti da proteine linker aggiuntive. Pertanto, ogni bastoncino di ficobilisoma contiene due o più esameri di ficocianina.
Cos'è l'alloficocianina?
L'alloficocianina è una molecola proteica che proviene dalla famiglia delle ficobiliproteine ed è un pigmento accessorio della clorofilla. Gli altri membri di questa famiglia di ficobiliproteine per la raccolta della luce includono ficocianina, ficoeritrina e ficoeritrocianina. I pigmenti di alloficocianina possono assorbire ed emettere luce rossa e possiamo facilmente trovare questo pigmento nei cianobatteri e nelle alghe rosse.
Figura 02: Aspetto dell'alloficocianina in un diagramma
Possiamo isolare l'alloficocianina da varie specie di alghe rosse o blu-verdi. Queste alghe producono forme leggermente diverse della molecola. Generalmente, la molecola di alloficocianina contiene due diverse subunità denominate subunità alfa e beta. Ogni subunità ha un cromoforo di ficocianobilina.
Ci sono diverse applicazioni dell'alloficocianina; molti strumenti sono stati sviluppati specificamente per l'alloficocianina. Ad esempio, questo componente è comunemente usato nei test immunologici, inclusi FACS, citometria a flusso, ecc.
Quali sono le somiglianze tra ficocianina e alloficocianina?
- La ficocianina e l'alloficocianina sono proteine idrosolubili
- Entrambi sono inclusi nella famiglia delle ficobiliproteine.
Qual è la differenza tra ficocianina e alloficocianina?
Le ficobiliproteine sono una famiglia di proteine idrosolubili presenti nei cianobatteri e in alcune specie di alghe. La ficocianina e l'alloficocianina sono due membri principali di questa famiglia. La differenza chiave tra ficocianina e alloficocianina è che la ficocianina assorbe ed emette a lunghezze d'onda più corte rispetto all'alloficocianina.
Di seguito l'infografica elenca più differenze tra ficocianina e alloficocianina in forma tabellare per il confronto fianco a fianco.
Riepilogo – Ficocianina vs alloficocianina
Le ficobiliproteine sono una famiglia di proteine idrosolubili presenti nei cianobatteri e in alcune specie di alghe. La ficocianina e l'alloficocianina sono due membri principali di questa famiglia. La differenza chiave tra ficocianina e alloficocianina è che la ficocianina assorbe ed emette a lunghezze d'onda più corte rispetto all'alloficocianina.
