La differenza chiave tra subunità proteica e dominio è che una subunità proteica è una catena polipeptidica separata di una proteina che si assembla con altre catene polipeptidiche per formare un complesso proteico mentre un dominio proteico è una regione contigua della catena polipeptidica di una proteina che spesso si ripiega indipendentemente in un'unità compatta, locale e semi-indipendente.
La subunità e il dominio della proteina sono parti molto importanti di una proteina multimerica. Le proteine sono polimeri costituiti da polipeptidi. Ciascuna catena polipeptidica si forma da un monomero noto come amminoacido. Una proteina complessa contiene unità strutturali distinte come subunità, domini, motivo e piega. Queste unità strutturali di una proteina complessa sono estremamente importanti per la sua struttura e, in definitiva, per la sua funzione.
Cos'è una subunità proteica?
Una subunità proteica è una catena polipeptidica separata di una proteina che si assembla con altre catene polipeptidiche per formare un complesso proteico. Nella biologia strutturale, una subunità proteica è una singola molecola proteica che si assembla con altre molecole proteiche per formare un complesso proteico. Le proteine presenti in natura hanno un numero relativamente piccolo di subunità, come l'emoglobina e la DNA polimerasi. Pertanto, sono chiamati oligomerici. Altre proteine sono costituite da un gran numero di subunità, quindi sono descritte come multimeriche. Ad esempio, i microtubuli e altre proteine del citoscheletro sono multimerici. Le subunità della proteina multimerica possono essere identiche (omologa) o totalmente dissimili (eterologo).
Figura 01: Subunità proteica
In alcune proteine multimeriche, una subunità può essere una subunità catalitica. D' altra parte, l' altro è una subunità normativa. La funzione della subunità catalitica sta catalizzando la reazione enzimatica mentre la funzione della subunità regolatoria sta facilitando o inibendo la sua attività. Un enzima costituito da subunità catalitiche e regolatorie quando assemblato viene solitamente definito oloenzima. Ad esempio, l'enzima di classe I fosfoinositide 3-chinasi ha una subunità catalitica p110 e una subunità regolatrice p85. Inoltre, una proteina deve avere un gene per ogni subunità. Questo perché una subunità è costituita da una catena polipeptidica separata che ha un gene codificante.
Cos'è un dominio proteico?
Un dominio proteico è una regione contigua della catena polipeptidica di una proteina che spesso si ripiega indipendentemente in unità compatte, locali e semi-indipendenti. Il dominio di una proteina è anche noto come una regione della catena polipeptidica della proteina che si autostabilizza e si piega indipendentemente dal resto. Sono un'unità strutturale e funzionale distinta in una proteina. Normalmente, i domini sono responsabili di una funzione specifica o di un'interazione che contribuisce al ruolo generale della proteina. Ad esempio, il dominio SH3 è composto da circa 50 residui di amminoacidi. Si trovano in una vasta gamma di proteine, comprese le proteine adattatrici, le fosfatidilinositolo3-chinasi, le fosfolipasi e le miosine. Questi domini SH3 sono coinvolti nelle interazioni proteina-proteina.
Figura 02: Domini proteici
I domini variano in lunghezza da 50 aminoacidi a 250 aminoacidi. I domini più corti, come il dito di zinco, sono stabilizzati da ioni metallici e ponti disolfuro. Un dominio produce spesso unità funzionali come il dominio della mano EF legante il calcio della calmodulina. Inoltre, i domini possono essere scambiati tramite l'ingegneria genetica tra una proteina e un' altra per creare proteine chimeriche.
Quali sono le somiglianze tra subunità proteica e dominio?
- La subunità e il dominio della proteina sono unità strutturali di una proteina multimerica.
- Entrambi sono costituiti da amminoacidi.
- Sono collegati al termine “catena polipeptidica”.
- Inoltre, sono entrambi estremamente importanti per la funzione complessiva della proteina.
Qual è la differenza tra subunità proteica e dominio?
Una subunità proteica è una catena polipeptidica separata di una proteina che si assembla con altre catene polipeptidiche per formare un complesso proteico. D' altra parte, un dominio proteico è una regione contigua della catena polipeptidica di una proteina che spesso si ripiega indipendentemente in unità compatte, locali e semi-indipendenti. Quindi, questa è la differenza chiave tra subunità proteica e dominio. Inoltre, una subunità proteica è di dimensioni maggiori di un dominio proteico.
La tabella seguente riassume la differenza tra subunità proteica e dominio in forma tabellare.
Riepilogo – Subunità proteica vs dominio
Gli elementi costitutivi delle proteine sono gli aminoacidi. Le proteine sono formate dalla condensazione degli amminoacidi. Le strutture proteiche variano in dimensioni da decine a diverse migliaia di aminoacidi. Una struttura proteica è stabilizzata da interazioni non covalenti come legami idrogeno, legami ionici, forze di Van der Waals, legami idrofobici e interazioni covalenti come legami disolfuro. Una proteina complessa contiene unità strutturali distinte come subunità, domini, motivo e piega. Una subunità proteica è una catena polipeptidica separata di una proteina che si assembla con altre catene polipeptidiche per formare un complesso proteico. D' altra parte, il dominio proteico è una regione della catena polipeptidica della proteina che si autostabilizza e si piega indipendentemente dal resto. Quindi, questo è il riassunto della differenza tra subunità proteica e dominio.
