La differenza chiave tra snRNA e snoRNA è che snRNA implica lo splicing alternativo del pre-mRNA mentre snoRNA implica la modifica di rRNA e tRNA, l'editing dell'mRNA e l'imprinting del genoma.
I piccoli RNA sono molecole di RNA polimerico costituite da meno di 200 nucleotidi. Di solito non sono codificanti. Esistono tra gli RNA messaggeri per trasportare segnali. I piccoli RNA provengono da un perfetto RNA a doppio filamento, che è prodotto dall'azione della RNA polimerasi RNA-dipendente. I piccoli RNA svolgono un ruolo importante nella differenziazione, nella crescita e nella proliferazione cellulare, nell'apoptosi, nel metabolismo, nella migrazione e nella difesa. Pertanto, i piccoli RNA sono regolatori importanti e critici dello sviluppo e della fisiologia. Il piccolo RNA nucleare e il piccolo RNA nucleolare sono due classi di piccole molecole di RNA.
Cos'è snRNA?
Il piccolo RNA nucleare o snRNA è una classe di piccole molecole di RNA che si trovano nel nucleo delle cellule eucariotiche. La lunghezza media di un snRNA è di circa 150 nucleotidi. L'RNA polimerasi II o l'RNA polimerasi III trascrivono snRNA. La funzione principale dell'snRNA è l'elaborazione dell'RNA pre-messaggero nel nucleo. Aiutano anche a regolare i fattori di trascrizione o l'RNA polimerasi II ea mantenere i telomeri.
Figura 01: Meccanismo d'azione del piccolo RNA
Ci sono due classi di snRNA basate su caratteristiche di sequenza comuni e fattori proteici associati come la proteina LSm che lega l'RNA. Le due classi sono snRNA di classe Sm e snRNA di classe Lsm. L'snRNA di classe Sm è costituito da un elevato contenuto di uridina di U1, U2, U4, U4atac, U5, U7, U11 e U12. L'RNA polimerasi II trascrive snRNA di classe SM. Dopo la trascrizione del pre-snRNA, di solito ricevono un cappuccio di 7-metilguanosina 5' nel nucleo. Quindi vengono esportati nel citoplasma attraverso i pori nucleari per un'ulteriore elaborazione. L'snRNA di classe Lsm ha un alto contenuto di uridina di U6 e U6atac. L'RNA polimerasi III trascrive l'snRNA di classe Lsm e non lascia il nucleo. I componenti dell'snRNA umano più comuni sono l'RNA spliceosomale U1, l'RNA spliceosomale U2, l'RNA spliceosomale U4, l'RNA spliceosomale U5 e l'RNA spliceosomale U6.
Cos'è snoRNA?
Il piccolo RNA nucleolare o snoRNA è una classe di piccole molecole di RNA che guidano le modificazioni chimiche in altri RNA come l'RNA ribosomiale, l'RNA di trasferimento e il piccolo RNA nucleare. Ogni molecola di snoRNA è associata a circa quattro proteine principali nel complesso RNA/proteina durante il processo di modifica. Lo snoRNA contiene un elemento antisenso che è di circa 10-20 nucleotidi. Queste basi sono complementari alla sequenza che circonda i nucleotidi che mirano alla modifica nella molecola del pre-RNA.
Figura 02: Piccolo RNA nucleare
Ci sono due classi di snoRNA. Sono la scatola C/D snoRNA e la scatola H/ACA snoRNA. C/D box snoRNA è associato alla metilazione e H/ACA box snoRNA è associato alla pseudo-uridilazione. Ogni molecola di snoRNA funge da guida per una o due modifiche in un RNA bersaglio. C/D box snoRNA contiene due brevi motivi di sequenza conservati C e D, rispettivamente vicino alle estremità 5' e 3' dello snoRNA. Brevi regioni costituite da 5 nucleotidi si dispongono a monte della scatola C ea valle della scatola D e formano una struttura stem-box. Questo avvicina i motivi della scatola C e D. La struttura stem-box è importante per la corretta sintesi dello snoRNA e per la localizzazione nucleolare. H/ACA box snoRNA ha una struttura secondaria costituita da due forcine e due regioni a filamento singolo. Questa è comunemente nota come struttura a forcina-cerniera-tornante-coda. H/ACA box snoRNA comprende anche due motivi conservati H e ACA. Entrambi si trovano in regioni a filamento singolo. La scatola H è nella cerniera e l'ACA è nella regione della coda. Tre nucleotidi formano l'estremità 3' della sequenza.
Quali sono le somiglianze tra snRNA e snoRNA?
- snRNA e snoRNA sono piccoli RNA.
- Entrambi sono presenti nelle cellule eucariotiche.
- Entrambi sono molecole di RNA non codificanti.
- Inoltre, partecipano alla modifica dell'RNA durante il processo di trascrizione.
Qual è la differenza tra snRNA e snoRNA?
snRNA partecipa allo splicing alternativo del pre-mRNA mentre lo snoRNA modifica principalmente le molecole di RNA. Pertanto, questa è la differenza chiave tra snRNA e snoRNA. Inoltre, gli snRNA sono lunghi circa 150 nucleotidi e si trovano spesso legati a un gruppo di proteine e complessi chiamati piccole ribonucleoproteine nucleari. Gli snoRNA sono lunghi circa 60-170 nucleotidi e si trovano principalmente nel nucleolo.
Inoltre, gli snRNA vengono trascritti dall'RNA polimerasi II o dall'RNA polimerasi III mentre lo snoRNA viene trascritto solo dall'RNA polimerasi II.
L'infografica qui sotto presenta le differenze tra snRNA e snoRNA in forma tabellare per un confronto fianco a fianco.
Riepilogo – snRNA vs snoRNA
snRNA e snoRNA sono classi di piccole molecole di RNA. snRNA partecipa allo splicing alternativo del pre-mRNA mentre snoRNA modifica principalmente le molecole di RNA. Pertanto, questa è la differenza chiave tra snRNA e snoRNA. I piccoli RNA sono molecole di RNA polimerico costituite da meno di 200 nucleotidi di lunghezza e di solito non codificanti. Gli snRNA si trovano nel nucleo degli eucarioti. Gli snoRNA si trovano negli archaea e negli eucarioti. La trascrizione dello snRNA avviene attraverso l'RNA polimerasi II e II, mentre solo l'RNA polimerasi II è coinvolta nella trascrizione dello snoRNA. Quindi, questo riassume la differenza tra snRNA e snoRNA.
