Agarosio vs Poliacrilammide
Agarosio e Poliacrilammide sono entrambi polimeri idrosolubili ma, tra loro, si possono notare molte differenze, a partire dalla loro origine. Sia l'agarosio che la poliacrilammide hanno qualcosa in comune nella loro capacità di formare matrici di gel porose. Nonostante ciò, esistono una serie di differenze distinte tra i due. Le principali differenze tra questi due polimeri risiedono nella loro natura di origine, struttura chimica, i loro diversi usi e le loro prestazioni in termini di elettroforesi su gel.
Cos'è l'agarose?
L'agarosio è un polimero lineare presente in natura che a sua volta è derivato da un polimero complesso chiamato agar che si trova nelle alghe. L'agarosio viene estratto dall'agar rimuovendo la sua componente proteica chiamata agaropectina. L'agarosio è ciò che conferisce all'agar la sua capacità di formare gel.
L'uso principale dell'agarosio è negli studi microbiologici e di biologia molecolare. Negli studi microbiologici, l'agarosio, quando integrato con nutrienti adeguati, fornisce una solida base per la coltivazione di microrganismi come batteri e funghi. Se utilizzato a concentrazioni semisolide, può essere utile per valutare la motilità di questi microrganismi. In biologia molecolare, funge da strumento importante per uno dei processi di risoluzione più fondamentali chiamati "elettroforesi su gel" o "elettroforesi su gel di agarosio" (AGE). L'elettroforesi su gel è un processo che consente la risoluzione o la separazione di acidi nucleici o proteine in base alla loro dimensione e carica. Qui, l'agarosio funge da gel poroso simile a un setaccio attraverso il quale avviene la separazione.
Struttura dell'agarose
Cos'è il poliacrilammide?
Il poliacrilammide è un polimero sintetico e viene utilizzato in un'ampia varietà di settori. Come accennato in precedenza, il suo utilizzo si basa sulla sua capacità di formare gel. Tuttavia, oltre a questo, la sua capacità di trattenere e drenare l'acqua a diverse concentrazioni viene sfruttata anche in vari settori.
L'uso più diffuso e comune della poliacrilammide è nel trattamento delle acque reflue. Qui viene utilizzato come flocculante per rimuovere eventuale materiale organico in sospensione; quindi, migliorando la torbidità e chiarendo l'acqua. Un altro uso della poliacrilammide è nell'industria della carta. Qui viene utilizzato per trattenere o drenare l'acqua dalla polpa di carta secondo necessità. Allo stesso modo, nei settori agricolo e edile, viene utilizzato come ammendante per prevenire l'erosione del suolo e migliorarne la qualità.
Come l'agarosio, anche il poliacrilammide viene utilizzato in biologia molecolare come un importante strumento di risoluzione in un processo simile chiamato "Elettroforesi su gel di poliacrilammide" (PAGE). Oltre a tutto questo, il poliacrilammide viene utilizzato anche nella lavorazione del minerale e nella produzione di agenti flocculanti per rimuovere qualsiasi materiale organico in sospensione; quindi, migliorando la torbidità e chiarendo l'acqua. Un altro uso della poliacrilammide è nell'industria della carta. Qui viene utilizzato per trattenere o drenare l'acqua dalla polpa di carta secondo necessità. Allo stesso modo, nell'industria agricola e edile, viene utilizzato come ammendante per prevenire l'erosione del suolo e migliorarne la qualità. Oltre a tutto questo, il poliacrilammide viene utilizzato anche nella produzione di additivi alimentari, lenti a contatto morbide e tessuti.
Struttura in poliacrilammide
Qual è la differenza tra agarosio e poliacrilammide?
Origine di agarosio e poliacrilammide:
Agarose: L'agarose è un polimero di origine naturale. È derivato dalle alghe.
Poliacrilammide: il poliacrilammide è di origine sintetica e non si trova in nessuna circostanza naturale.
Formula molecolare di agarosio e poliacrilammide:
Agarose: La formula molecolare dell'agarose è C24H38O19.
Poliacrilammide: la formula molecolare della poliacrilammide è (C 3H5NO)n.
Struttura chimica di agarosio e poliacrilammide:
Agarose: L'agarose è un polisaccaride lineare. È costituito da unità disaccaridiche ripetute chiamate agrobiosio tenute insieme da legami a idrogeno.
Poliacrilammide: il poliacrilammide è un polimero reticolato chimicamente. È costituito da monomeri di acrilammide e da un agente reticolante N, N'-metilenbisacrilammide.
Tossicità dell'agarosio e della poliacrilammide:
Agarose: Sia l'agarose che la sua unità monomerica agrobiose sono di natura non tossica.
Poliacrilammide: l'unità monomerica di poliacrilammide, l'acrilammide, è un presunto cancerogeno e nota neurotossina mentre la sua forma polimerizzata è di natura non tossica.
Caratteristiche dei gel di agarosio e poliacrilammide:
ETÀ e PAGINA:
Agarosio: la preparazione del gel di agarosio per AGE richiede meno tempo, è facile e semplice e non richiede un iniziatore o un catalizzatore polimerizzante.
Poliacrilammide: la preparazione del gel di poliacrilammide per PAGE richiede tempo e noiosa e richiede anche un iniziatore (persolfato di ammonio) e un catalizzatore polimerizzante (N, N, N', N'-tetrametiletilendiammina – TEMED).
Natura:
I gel di poliacrilammide sono chimicamente più stabili dei gel di agarosio.
Dimensione dei pori:
Data la stessa concentrazione, le matrici in gel di poliacrilammide tendono ad avere dimensioni dei pori inferiori rispetto a quelle di una matrice in gel di agarosio.
Alterare la dimensione dei pori:
La dimensione dei pori dei gel di poliacrilammide può essere modificata in modo più controllato rispetto a quella dei gel di agarosio.
Potere risolutivo:
I gel di poliacrilammide hanno un alto potere risolutivo mentre i gel di agarosio hanno un basso potere risolutivo.
Acido nucleico accomodante:
I gel di poliacrilammide possono contenere quantità maggiori di acido nucleico rispetto ai gel di agarosio per mezzi di risoluzione.
