La differenza fondamentale tra xilene cianolo e blu di bromofenolo è che nel gel di agarosio all'1%, lo xilene cianolo migra più lentamente, mentre il blu di bromofenolo migra più velocemente.
Il cianolo xilene e il blu di bromofenolo sono importanti come marcatori di colore che possono essere utilizzati nel monitoraggio del processo di elettroforesi su gel di agarosio ed elettroforesi su gel di poliacrilammide.
Cos'è lo xilene cianolo?
Xylene cyanol è un marcatore di colore elettroforetico o un colorante di tracciamento. È utile nel monitoraggio del processo di elettroforesi su gel di agarosio e elettroforesi su gel di poliacrilammide. Quando questa sostanza viene miscelata con il campione, la concentrazione di questa sostanza diventa in genere circa 0. Da 005% a 0,03%. Alcuni sinonimi che possiamo usare per xilene cianolo includono Acid Blue 147, xilene cianolo, xilene cianolo FF, xilene cianolo FF, ecc.
La formula chimica di questo composto è C25H27N2NaO 6S2 La massa molare dello xilene cianolo è 538,61 g/mol. Questa sostanza può migrare a una velocità di circa 4-5 frammenti di DNA di coppie di kilobasi in gel di agarosio all'1%. Tuttavia, questo dipende dal buffer che utilizziamo. Tipicamente, lo xilene cianolo su gel di poliacrilammide al 6% può migrare a una velocità di circa 140 frammenti di DNA di coppie di basi. D' altra parte, può migrare nell'elettroforesi su gel di poliacrilammide denaturante al 20% a una velocità di 25 basi di oligonucleotide.
Il conteggio dei donatori del legame idrogeno dello xilene cianolo è di 2 m e il conteggio degli accettori del legame idrogeno è 8. Il conteggio dei legami ruotabili di questo composto può essere dato come 7. La complessità dello xilene cianolo può essere descritta come 1120 gradi. Ha un conteggio stereocentro del legame definito di 1.
Cos'è il blu di bromofenolo?
Il blu di bromofenolo è un utile indicatore di pH utile come marcatore di colore elettroforetico e colorante. Ha il nome chimico 3', 3", 5', 5"-tetrabromofenolsolfonftaleina, BPB. La formula chimica di questo composto è C19H10Br4O5 S. La massa molare di questo composto è 669,96 g/mol. È inodore e la sua densità può essere di 2,2 g/mL. Il suo punto di fusione è di 273 gradi Celsius e il suo punto di ebollizione è di 279 gradi Celsius. Possiamo prepararlo aggiungendo lentamente bromo in eccesso a una soluzione calda di fenolsolfonftaleina in acido acetico glaciale.
Il blu di bromofenolo è utile come indicatore acido-base nell'intervallo tra pH 3,0 e 4,6. È in grado di passare dal giallo a pH 3,0 a pH 4,6. Inoltre, è una reazione reversibile. Strutturalmente, il blu di bromofenolo è simile alla fenolftaleina.
Inoltre, possiamo usarlo come pennarello colorato per monitorare il processo di elettroforesi su gel di agarosio e elettroforesi su gel di poliacrilammide. Questa sostanza può trasportare una carica negativa a pH moderato, dove può migrare nella stessa direzione del DNA o delle proteine in un gel. La velocità di migrazione può variare in base alla densità del gel e alla composizione del tampone. Tuttavia, in un tipico gel di agarosio all'1% in tampone TAE 1 volta o tampone TBE, questa sostanza migra alla stessa velocità di un frammento di DNA di circa 300 coppie di basi.
Qual è la differenza tra xilene cianolo e blu di bromofenolo?
Xilene cianolo e blu di bromofenolo sono importanti marcatori di colore. Il differenza fondamentale tra xilene cianolo e blu di bromofenolo è quello nel gel di agarosio all'1%, lo xilene cianolo migra più lentamente, mentre il blu di bromofenolo migra più velocemente.
Di seguito è riportato un riepilogo della differenza tra xilene cianolo e blu di bromofenolo in forma tabellare per un confronto fianco a fianco.
Riepilogo – Xilene cianolo vs blu di bromofenolo
Xilene cianolo e blu di bromofenolo sono importanti come marcatori di colore utilizzati nel monitoraggio del processo di elettroforesi su gel di agarosio e elettroforesi su gel di poliacrilammide. Il differenza fondamentale tra xilene cianolo e blu di bromofenolo è quello nel gel di agarosio all'1%, lo xilene cianolo migra più lentamente mentre il blu di bromofenolo migra più velocemente.
